ARN circular

Los ARN circulares (circRNA) son ARN no codificantes que forman estructuras circulares y tienen múltiples funciones reguladoras, incluida la competencia con los miARN por los genes diana y la unión a proteínas. La tubería de circRNA de BMKCloud está diseñada para el análisis de bibliotecas agotadas de ARNr con un genoma de referencia bien anotado y de alta calidad. El análisis comienza con el recorte de lectura y el control de calidad, seguido de la alineación de la lectura con el genoma de referencia y la predicción de nuevos circRNA, junto con la identificación de circRNA conocidos a partir de bases de datos. Posteriormente se identifican las dianas de miARN correspondientes y los huéspedes de ARNcirc. El análisis de expresión diferencial revela ARNcirc expresados ​​diferencialmente y los huéspedes correspondientes están funcionalmente anotados para extraer funciones biológicas enriquecidas.