Resecuenciación del genoma completo de bacterias y hongos
Los proyectos de resecuenciación del genoma completo de bacterias y hongos son fundamentales para avanzar en la genómica microbiana al permitir completar y comparar genomas microbianos. Esto facilita la ingeniería de fermentación, la optimización de procesos industriales y la exploración de vías de metabolismo secundario. Además, la resecuenciación de hongos y bacterias es crucial para comprender la adaptación ambiental, optimizar las cepas y revelar la dinámica de la evolución genética, con amplias implicaciones en la medicina, la agricultura y las ciencias ambientales.
Ventajas del servicio
●El análisis bioinformático incluye llamadas de variantes:Proporcionar información funcional sobre los genomas resecuenciados.
● Amplia experiencia: Con miles de proyectos de resecuenciación microbiana realizados anualmente, aportamos más de una década de experiencia, un equipo de análisis altamente capacitado, contenido integral y un excelente soporte posventa.
●Soporte Postventa:Nuestro compromiso se extiende más allá de la finalización del proyecto con un período de servicio postventa de 3 meses. Durante este tiempo, ofrecemos seguimiento del proyecto, asistencia para la resolución de problemas y sesiones de preguntas y respuestas para abordar cualquier consulta relacionada con los resultados.
Especificaciones de servicio
| Plataforma de secuenciación | Estrategia de secuenciación | Datos recomendados | Control de calidad |
| Illumina NovaSeq | PE150 | Profundidad de 100x | Q30≥85% |
Requisitos de muestra
| Concentración (ng/μL) | Importe total (ng) | Volumen (μL) |
| ≥1 | ≥60 | ≥20 |
Bacterias: ≥1x107 células
Hongos unicelulares: ≥5x106-1x107 células
Hongos macro: ≥4g
Flujo de trabajo del servicio
Entrega de muestra
construcción de biblioteca
Secuenciación
Análisis de datos
Servicios postventa
Incluye el siguiente análisis:
- Control de calidad de datos de secuenciación
- Alineación con el genoma de referencia
- Llamada variante: SNP e InDel
- Anotación variante
Llamada de variantes: tipos de SNP
Llamada de variantes: distribución de longitud de InDel
Explore los avances facilitados por los servicios de resecuenciación del genoma microbiano de BMKGene a través de una colección seleccionada de publicaciones.
Jia, Y. et al. (2023) 'Combinación del transcriptoma y la resecuenciación del genoma completo para detectar genes de resistencia a enfermedades del carbón enano del trigo',Revista internacional de ciencias moleculares., 24(24). doi: 10.3390/IJMS242417356.
Jiang, M. y col. (2023) 'El metabolismo de la glucosa controlado por ampicilina manipula la transición de la tolerancia a la resistencia en las bacterias',Avances científicos, 9(10). doi: 10.1126/SCIADV.ADE8582/SUPPL_FILE/SCIADV.ADE8582_SM.PDF.
Yang, M. y col. (2022) 'Aliidiomarina halalkaliphila sp. nov., una bacteria haloalcalófila aislada de un lago de soda en la Región Autónoma de Mongolia Interior, China', Int. J. Sistema. Evolución.microbiol, 72, pág. 5263. doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. y Wang, G.-H. (2024) 'Secuencia del genoma de Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, aislado de Nasonia vitripennis',Anuncios de recursos de microbiología. doi: 10.1128/MRA.00802-23.
