Montaje del genoma bacteriano de novo
Proporcionamos un servicio completo de ensamblaje del genoma bacteriano, garantizando 0 brechas. Esto es posible integrando tecnologías de secuenciación de lectura a largo plazo, como Nanopore y PACBIO para el ensamblaje y la secuenciación de lectura corta con Illumina para la validación de ensamblaje y la corrección de errores de las lecturas ONT. Nuestro servicio proporciona el flujo de trabajo bioinformático completo del ensamblaje, la anotación funcional y el análisis bioinformático avanzado, cumpliendo objetivos de investigación específicos. Este servicio permite el desarrollo de genomas de referencia precisos para varios estudios genéticos y genómicos. Además, forma la base de aplicaciones como la optimización de la cepa, la ingeniería genética y el desarrollo de la tecnología microbiana, asegurando datos genómicos confiables y sin brujas cruciales para avanzar en los conocimientos científicos e innovación biotecnológica.
Características de servicio
● Con dos opciones posibles para elegir dependiendo del grado deseado de integridad del genoma.
● Borrador de la opción del genoma: secuenciación de lectura corta con Illumina Novaseq PE150.
● Complete 0 GRAP GENOM.
● Secuenciación de lectura larga en Nanopore Promethion 48 o Pacbio Revio para el ensamblaje del genoma.
● Secuenciación de lectura corta en Illumina Novaseq para la validación del genoma y la corrección de errores (nanopore) o para generar un borrador del genoma.
Ventajas de servicio
●Genoma de la brecha cero garantizada: Esto se debe a la integración de la secuenciación de Illumina con secuenciación de lectura larga (nanopore o PACBIO).
●Flujo de trabajo bioinformático completo:Esto incluye el ensamblaje del genoma y la predicción de múltiples elementos genómicos, anotación de genes funcionales y visualizaciones del genoma como Circos Plot.
●Experiencia extensa: Con más de 20,000 genomas microbianos ensamblados, BMKGene trae más de una década de experiencia, un equipo de análisis altamente calificado, contenido integral y excelente soporte posterior a las ventas.
●Soporte posterior a las ventas:Nuestro compromiso se extiende más allá de la finalización del proyecto con un período de servicio posterior a la venta de 3 meses. Durante este tiempo, ofrecemos seguimiento del proyecto, asistencia de problemas de problemas y sesiones de preguntas y respuestas para abordar cualquier consulta relacionada con los resultados.
●Múltiples estrategias de secuenciación disponibles:Para diferentes objetivos de investigación y requisitos de integridad del genoma.
Especificaciones de servicio
| Servicio | Estrategia de secuenciación |
| Borrador de genoma | Illumina PE150 100X |
| 0 Genoma GAP | Nanopore 100x + Illumina PE150 100X Or PACBIO HIFI 30X + ILLUMINA PE150 100X (opcional) |
Requisitos de muestra:
| Concentración (ng/µl) | Cantidad total (µg) | Volumen (µl) | OD260/280 | OD260/230 | |
| Pacbio | ≥20 | ≥1.2 | ≥20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanoporo | ≥40 | ≥2 | ≥20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Ilumina | ≥1 | ≥0.06 | ≥20 | - | - |
· Bacterias: ≥3.5x1010 células
Flujo de trabajo de servicio
Entrega de muestra
Construcción de la biblioteca
Secuenciación
Análisis de datos
Servicios posteriores
Incluye el siguiente análisis:
● Control de calidad de datos de secuenciación
● Asamblea del genoma
● Análisis de componentes del genoma: predicción de CDS y elementos genómicos múltiples
● Anotación funcional con múltiples bases de datos generales (GO, Kegg, etc.) y bases de datos avanzadas (tarjeta, VFDB, etc.)
● Visualización del genoma
Proporcionamos el genoma en un formato FASTA fácilmente accesible y el archivo de anotación del genoma (GFF).
Anotación génica - Vete
Anotación génica - Carbohidratos Cazy
Visualización del genoma - Circos Plot
Explore los avances facilitados por los servicios de ensamblaje del genoma bacteriano de Bmkgene a través de una colección curada de publicaciones.
Dai, W. et al. (2023) 'Descubrimiento de Bacteroides uniformes F18-22 como una bacteria probiótica segura y nueva para el tratamiento de la colitis ulcerosa del colon humano sano',,Revista Internacional de Ciencias Moleculares, 24 (19), p. 14669. Doi: 10.3390/ijms241914669/s1.
Kang, Q. et al. (2021) 'Proteus mirabilis resistente a múltiples fármacos aislados que llevan Blaoxa-1 y BlaDM-1 de la vida silvestre en China: aumento del riesgo de salud pública',,Zoología integradora, 16 (6), pp. 798–809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'La secuencia completa del genoma de endófito bacillus flexus klbmp 4941 revela su mecanismo de promoción del crecimiento de las plantas y su base genética para la tolerancia a la sal',Revista de Biotecnología, 260, págs. 38–41. doi: 10.1016/j.jbiotec.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'Los plásmidos de resistencia de replicón múltiple de Klebsiella median una extensa diseminación de genes antimicrobianos',Fronteras en microbiología, 12, p. 754931. Doi: 10.3389/fmicb.2021.754931/bibtex.
