Tuta Transskriba Sekvenco - Illumina
Trajtoj
● Duobla biblioteko por sekvenci la kompletan transkriptomon: rRNA -elĉerpiĝo sekvita de PE150 -biblioteka preparado kaj grandeco -elekto sekvita de SE50 -biblioteka preparo
● Kompleta bioinformatika analizo de mRNA, lncRNA, circRNA, kaj miRNA en apartaj bioinformatikaj raportoj
● Komuna analizo de ĉiu RNA -esprimo en kombinita raporto, inkluzive de CERNA -retaj analizoj.
Servaj avantaĝoj
●Profunda analizo de reguligaj retoj: CERNA -reto -analizo estas ebligita per la komuna sekvenco de mRNA, lncRNA, circRNA, kaj miRNA kaj de ĝisfunda bioinformata fluo de laboro.
●Ampleksa komentario: Ni uzas multoblajn datumbazojn por funkcie noti la malsamajn esprimitajn genojn (DEG) kaj plenumi la respondan riĉigan analizon, provizante komprenojn pri la ĉelaj kaj molekulaj procezoj sub la transkripta respondo.
●Vasta kompetenteco: Kun trako de sukcese fermado de pli ol 2100 tutaj transkriptomaj projektoj en diversaj esploroj, nia teamo alportas riĉan sperton al ĉiu projekto.
●Rigora kvalitkontrolo: Ni efektivigas kernajn kontrolpunktojn tra ĉiuj stadioj, de specimeno kaj biblioteka preparo ĝis sekvencado kaj bioinformatiko. Ĉi tiu skrupula monitorado certigas la liveradon de konstante altkvalitaj rezultoj.
●Post-venda subteno: Nia devontigo etendas preter projekt-kompletigo kun 3-monata post-venda serva periodo. Dum ĉi tiu tempo, ni ofertas projektajn sekvojn, problemojn pri helpo, kaj Q & A-sesioj por trakti iujn ajn demandojn rilatajn al la rezultoj
Specimaj postuloj kaj liverado
| Biblioteko | Sekvenca Strategio | Datumoj Rekomenditaj | Kvalitkontrolo |
| rRNA elĉerpiĝis | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Grandeco elektita | Illumina SE50 | 10-20m legas |
Specimaj postuloj:
Nukleotidoj:
| Conc. (Ng/µl) | Kvanto (μg) | Pureco | Integreco |
| ≥ 80 | ≥ 1.6 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2,5 Limigita aŭ neniu proteino aŭ DNA -poluado montrita sur ĝelo. | Rin≥6.0 5.0≥28S/18S≥1.0; limigita aŭ neniu bazlinia alto |
Rekomendita ekzempla liverado
Ujo: 2 ml centrifuga tubo (stana folio ne rekomendas)
Specimena etikedado: Grupo+replikas ekz. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sendo:
1. Seka-glacio: Specimenoj devas esti enpakitaj en sakoj kaj entombigitaj en seka glacio.
2. RNAstable -tuboj: RNA -specimenoj povas esti sekigitaj en RNA -stabiliga tubo (ekz. RNAstable®) kaj ekspedita al ĉambra temperaturo.
Serva laborfluo
Eksperimenta Dezajno
Ekzempla liverado
RNA -eltiro
Biblioteko -Konstruado
Sekvenco
Datuma Analizo
Post-vendaj servoj
Bioinformatiko
RNA -Esprimo -Superrigardo
Malsame esprimitaj genoj
cerna analizo
Malsame esprimitaj miRNAoj kaj rilataj RNAoj
Esploru la esploradajn progresojn faciligitajn de Bmkgene 'tutaj transcriptomaj sekvencaj servoj per komisiita kolekto de publikaĵoj.
Dai, Y. et al. (2022) 'Kompletaj esprimaj profiloj de mRNAoj, lncRNAoj kaj miRNAoj en Kashin-Beck-malsano identigitaj per RNA-sekvencado', Molekulaj Omics, 18 (2), pp 154-166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, N. Nan et al. (2022) 'Plenlongaj transkriptomoj Analizo de malvarma rezisto de Apis Cerana en Changbai-monto dum superflua periodo.', Gene, 830, pp 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) 'Multi-omics-integriĝ-bazita prioritato de konkurencaj endogenaj RNA-reguligaj retoj en malgranda ĉela pulmkancero: molekulaj trajtoj kaj drogaj kandidatoj', Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, P. et al. (2022) 'Integrita analizo de la lncRNA/cirkrna-mirna-mRNA-esprimo-profiloj malkaŝas novajn komprenojn pri eblaj mekanismoj en respondo al radiko-nudaj nematodoj en arakido', BMC-genomiko, 23 (1), pp 1-12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/ciferoj/7.
Yan, Z. et al. (2022) 'Tuta-transcriptoma RNA-sekvencado reliefigas la molekulajn mekanismojn asociitajn kun la bontenado de postharvest-kvalito en brokolo per ruĝa LED-irradiado', post-rikolta biologio kaj teknologio, 188, p. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
