-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Spaca transcriptomics staras ĉe la avangardo de scienca novigado, rajtigante esploristojn enprofundiĝi en malsimplajn genesprimopadronojn ene de histoj konservante ilian spacan kuntekston. Inter diversaj platformoj, BMKGene evoluigis la BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Peceton, fanfaronante pri plibonigita rezolucio de 3.5µm, atingante la subĉelan gamon, kaj ebligante plurnivelajn rezoluciajn agordojn. La blato S3000, havanta proksimume 4 milionojn da makuloj, uzas mikroputojn tavoligitajn per bidoj ŝarĝitaj per space strekkoditaj kaptaj sondiloj. cDNA-biblioteko, riĉigita per spacaj strekkodoj, estas preparita de la S3000-peceto kaj poste sekvencita sur la Illumina NovaSeq-platformo. La kombinaĵo de space strekkoditaj provaĵoj kaj UMI-oj certigas la precizecon kaj specifecon de la datenoj generitaj. La blato BMKManu S3000 estas ege diverstalenta, ofertante multnivelajn rezoluciajn agordojn, kiuj povas esti fajne agorditaj al malsamaj histoj kaj dezirataj niveloj de detalo. Tiu adaptebleco poziciigas la peceton kiel elstara elekto por diversspecaj spacaj transcriptomics studoj, certigante precizan spacan amasiĝon kun minimuma bruo. La uzo de ĉela segmentigteknologio kun BMKManu S3000 ebligas la limado de transskribaj datenoj al la limoj de ĉeloj, rezultigante analizon kiu havas rektan biologian signifon. Krome, la plibonigita rezolucio de S3000 rezultigas pli altan nombron da genoj kaj UMIoj detektitaj per ĉelo, ebligante multe pli precizan analizon de la spacaj transskribaj ŝablonoj kaj amasiĝo de ĉeloj.
-
Ununuklea RNA-sekvencado
La evoluo de unuĉela kapto kaj kutimaj bibliotekkonstruaj teknikoj, kunligitaj kun alt-produkta sekvencado, revoluciigis genajn esprimojn sur la ĉelnivelo. Tiu sukceso permesas pli profundan kaj pli ampleksan analizon de kompleksaj ĉelpopulacioj, venkante la limigojn asociitajn kun averaĝi genekspresion super ĉiuj ĉeloj kaj konservante la veran heterogenecon ene de tiuj populacioj. Dum unuĉela RNA-sekvencado (scRNA-seq) havas nekontesteblajn avantaĝojn, ĝi renkontas defiojn en certaj histoj kie la kreado de unuĉela suspendo pruvas malfacila kaj postulas freŝajn provaĵojn. Ĉe BMKGene, ni traktas ĉi tiun obstaklon ofertante unukernan RNA-sekvencon (snRNA-seq) uzante la plej altnivelan teknologion 10X Genomics Chromium. Tiu aliro plilarĝigas la spektron de provaĵoj alireblaj al transkriptomanalizo sur la unuĉela nivelo.
La izolado de nukleoj estas plenumita per la noviga 10X Genomics Chromium-peceto, havante ok-kanalan mikrofluidikan sistemon kun duoblaj krucoj. Ene de tiu sistemo, ĝelperloj asimilantaj strekkodojn, enkondukojn, enzimojn, kaj ununuran nukleon estas enkapsuligitaj en nanoliter-grandaj oleogutoj, formante Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Sekvante GEM-formadon, ĉellizo kaj strekkodliberigo okazas ene de ĉiu GEM. Poste, mRNA-molekuloj spertas inversan transskribon en cDNAojn, asimilante 10X strekkodojn kaj Unique Molecular Identifiers (UMI). Tiuj cDNAoj tiam estas submetitaj al norma sekvenca bibliotekkonstruo, faciligante fortikan kaj ampleksan esploradon de genekspresioprofiloj sur la unuĉela nivelo.
Platformo: 10× Genomics Chromium kaj Illumina NovaSeq Platform
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Spaca transcriptomics estas avangarda teknologio kiu permesas al esploristoj esplori gen-esprimpadronojn ene de histoj konservante ilian spacan kuntekston. Unu potenca platformo en ĉi tiu domajno estas 10x Genomics Visium kunligita kun Illumina-sekvencado. La principo de 10X Visium kuŝas sur speciala blato kun elektita kapta areo kie histosekcioj estas metitaj. Tiu kaptareo enhavas strekkoditajn punktojn, ĉiu egalrilatante al unika spaca loko ene de la histo. La kaptitaj RNA-molekuloj de la histo tiam estas etikeditaj kun unikaj molekulaj identigiloj (UMI) dum la inversa transskriba procezo. Tiuj strekkoditaj punktoj kaj UMIoj ebligas precizan spacan mapadon kaj kvantigon de genekspresio ĉe unuĉela rezolucio. La kombinaĵo de space strekkoditaj provaĵoj kaj UMI-oj certigas la precizecon kaj specifecon de la datenoj generitaj. Uzante ĉi tiun Spatial Transcriptomics-teknologion, esploristoj povas akiri pli profundan komprenon de la spaca organizo de ĉeloj kaj la kompleksaj molekulaj interagoj okazantaj ene de histoj, ofertante valoregajn sciojn pri la mekanismoj subestaj biologiaj procezoj en multoblaj kampoj, inkluzive de onkologio, neŭroscienco, evolubiologio, imunologio. , kaj botanikaj studoj.
Platformo: 10X Genomics Visium kaj Illumina NovaSeq
