-
Kompara Genomiko
Kompara genaro implikas la ekzamenon kaj komparon de la tutaj genarsekvencoj kaj strukturoj inter malsamaj specioj. Tiu kampo serĉas riveli la evoluon de specioj, deĉifri genfunkciojn, kaj pliklarigi la genetikajn reguligajn mekanismojn identigante konservitajn aŭ diverĝajn sekvencstrukturojn kaj elementojn trans diversaj organismoj. Ampleksa kompara genomiko studo ampleksas analizojn kiel ekzemple genfamilioj, evolua evoluo, tut-genaromultobligaj okazaĵoj, kaj la efikon de selektemaj premoj.
-
Evolua Genetiko
Loĝantaro kaj evolua genetika analiza platformo estas establitaj surbaze de amasa sperto akumulita ene de BMK-R&D-teamo dum jaroj. Ĝi estas uzant-amika ilo precipe por esploristoj, kiuj ne specialiĝas pri bioinformadiko. Ĉi tiu platformo ebligas bazan analizon rilatan al baza evolua genetiko inkluzive de filogenetika arbokonstruado, analizo de ligmalekvilibro, taksado de genetika diverseco, analizo de selektema balaado, analizo de parenceco, PCA, analizo de populaciostrukturo ktp.
-
Hi-C Bazita Genaro-Asembleo
Hi-C estas metodo dizajnita por kapti kromosomkonfiguracion kombinante sondantajn proksimec-bazitajn interagojn kaj alt-trafian sekvencon. La intenseco de tiuj interagoj verŝajne estas negative korelaciita kun fizika distanco sur kromosomoj. Tial, Hi-C-datenoj estas utiligitaj por gvidi la grupigon, ordigon kaj orientiĝon de kunvenitaj sekvencoj en skiza genaro kaj ankri tiujn sur certa nombro da kromosomoj. Tiu teknologio povigas kromosom-nivelan genaron en la foresto de populaci-bazita genetika mapo. Ĉiu ununura genaro bezonas Hi-C.
-
Plant/Animal De Novo Genome Sequencing
De Novosekvencado rilatas al la konstruado de la tuta genaro de specio uzanta sekvencteknologiojn en la foresto de referenca genaro. La enkonduko kaj ĝeneraligita adopto de triageneracia sekvencado, havanta pli longajn legadojn, signife plibonigis genararon pliigante la interkovron inter legaĵoj. Tiu plibonigo estas precipe trafa kiam traktas malfacilajn genarojn, kiel ekzemple tiuj elmontrantaj altan heterozigosecon, altan rilatumon de ripetemaj regionoj, poliploidoj, kaj regionoj kun ripetemaj elementoj, nenormalaj GC-enhavoj, aŭ altan kompleksecon kiuj estas tipe nebone kunvenitaj uzante mallonglegan sekvencon. sole.
Nia unuhalta solvo provizas integrajn sekvencajn servojn kaj bioinformatikan analizon, kiuj liveras altkvalitan de novo kunmetitan genaron. Komenca genarenketo kun Illumina disponigas taksojn de genargrandeco kaj komplekseco, kaj ĉi tiuj informoj estas uzataj por gvidi la sekvan paŝon de longlega sekvencado kun PacBio HiFi, sekvita dede novokunigo de kontigs. La posta uzo de HiC-asembleo ebligas ankron de la kontigs al la genaro, akirante kromosom-nivelan kunigon. Finfine, la genaro estas komentita per genprognozo kaj sekvencante esprimitajn genojn, frekventante transkriptomoj kun mallongaj kaj longaj legadoj.
-
Homa Tuta Ekzoma Sekvencado
Human Whole exome-sekvencado (hWES) estas vaste agnoskita kiel kostefika kaj potenca sekvencaliro por indiki malsan-kaŭzantajn mutaciojn. Malgraŭ konstituado de nur proksimume 1.7% de la tuta genaro, ekson ludas decidan rolon rekte reflektante la profilon de totalaj proteinfunkcioj. Precipe, en la homa genaro, pli ol 85% de mutacioj ligitaj al malsanoj manifestiĝas ene de la protein-kodaj regionoj. BMKGENE ofertas ampleksan kaj flekseblan homan tutan ekzome-sekvencan servon kun du malsamaj ekson-kaptaj strategioj disponeblaj por plenumi diversajn esplorajn celojn.
-
Specif-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Altprodukta genotipado, precipe sur grandskalaj populacioj, estas fundamenta paŝo en genetikaj asociostudoj kaj disponigas genetikan bazon por funkcia geneltrovo, evolua analizo, ktp. Anstataŭ profunda tuta genar-resekvencado,Reduktita Reprezenta Genoma Sekvencado (RRGS)estas ofte utiligita en tiuj studoj por minimumigi sekvencan koston per provaĵo konservante akcepteblan efikecon en genetika signomalkovro. RRGS atingas tion digestante DNA kun restriktaj enzimoj kaj temigante specifan fragmentgrandecintervalon, tiel sekvencante nur frakcion de la genaro. Inter la diversaj RRGS-metodaroj, Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF) estas agordebla kaj altkvalita aliro. Ĉi tiu metodo, disvolvita sendepende de BMKGene, optimumigas la limigan enzimon aron por ĉiu projekto. Tio certigas la generacion de granda nombro da SLAF-etikedoj (400-500 bps-regionoj de la genaro estanta sekvencita) kiuj estas unuforme distribuitaj trans la genaro dum efike evitante ripetemajn regionojn, tiel certigante la plej bonan genetikan signomalkovron.
-
Illumina antaŭfaritaj bibliotekoj
Illumina sekvenca teknologio, bazita sur Sequencing by Synthesis (SBS), estas tutmonde akceptita NGS-novigado, respondeca por generado de pli ol 90% de la sekvencaj datenoj de la mondo. La principo de SBS implikas bildigi fluoreske etikeditajn reigeblajn finaĵojn kiam ĉiu dNTP estas aldonita, kaj poste fendita por permesi la enkadrigo de la venonta bazo. Kun ĉiuj kvar reigeblaj terminator-ligitaj dNTPoj ĉeestantaj en ĉiu sekvenca ciklo, natura konkurado minimumigas alkorpbiasion. Ĉi tiu diverstalenta teknologio subtenas kaj unulegeblajn kaj parigitajn bibliotekojn, servante gamon da genomaj aplikoj. La altproduktaj kapabloj kaj precizeco de Illumina sekvencado poziciigas ĝin kiel bazŝtonon en genomika esplorado, povigante sciencistojn malimpliki la komplikaĵojn de genaroj kun nekompareblaj detalo kaj efikeco.
Nia antaŭfarita biblioteko-sekvenca servo ebligas al klientoj prepari sinsekvajn bibliotekojn el diversaj fontoj (mRNA, tuta genaro, amplikono, 10x bibliotekoj, inter aliaj). Poste, ĉi tiuj bibliotekoj povas esti senditaj al niaj sekvencaj centroj por kvalito-kontrolo kaj sekvencado en platformoj Illumina.
