-
Ilaro
BMKCloud estas gvida bioinformatika platformo provizanta unuhaltan solvon por genomaj programoj, kiu estas vaste fidinda de esploristoj en diversaj arenoj inkluzive de medicina, agrikultura, media, ktp. BMKCloud kompromitas provizi integrajn, fidindajn kaj efikajn servojn inkluzive de bioinformatikaj analizaj platformoj kaj iloj. , komputikresursoj, publika datumbazo, bioinformaj interretaj kursoj, ktp. BMKCloud havas diversajn ofte uzatajn bioinformatikajn ilojn inkluzivi genan komentarion, evoluajn genetikajn ilojn, ncRNA, datuman kvalitkontrolon, kunigon, vicigon, dateneltiron, mutaciojn, statistikojn, figurogeneratoron, sekvencanalizon, ktp.
-
De novo Bacterial Genome Assembly
Ni provizas kompletan servon de asembleo de bakteria genaro, garantiante 0 breĉojn. Ĉi tio eblas per integrado de long-legaj sekvencaj teknologioj, kiel ekzemple Nanopore kaj PacBio por kunigo kaj mallonglega sekvencado kun Illumina por kunigvalidigo kaj erarkorektado de ONT-legoj. Nia servo provizas la kompletan bioinformatikan laborfluon de kunigo, funkcia komentario kaj altnivela bioinformatika analizo, plenumante specifajn esplorcelojn. Ĉi tiu servo ebligas la disvolviĝon de precizaj referencaj genaroj por diversaj genetikaj kaj genomaj studoj. Plie, ĝi formas la bazon por aplikoj kiel trostreĉ-optimumigo, genetika inĝenierado kaj mikroba teknologio-disvolviĝo, certigante fidindajn kaj liberajn genomajn datumojn decidajn por antaŭenigi sciencajn komprenojn kaj bioteknologian novigon.
-
malgranda RNA
Malgrandaj RNAoj estas speco de mallonga ne-ĉifra RNA kun meza longo de 18-30 nt, inkluzive de miRNA, siRNA kaj piRNA. Tiuj malgrandaj RNA-oj estis amase raportitaj esti implikitaj en diversaj biologiaj procezoj kiel ekzemple mRNA-degenero, tradukinhibicio, heterokromatina formado, ktp. SmallRNA-sekvencanalizo estis vaste aplikita en studoj pri besto/planta evoluo, malsano, viruso, ktp. Malgranda RNA sekvenca analiza platformo konsistas el norma analizo kaj altnivela datumminado. Surbaze de RNA-seq-datenoj, norma analizo povas atingi miRNA-identigon kaj prognozon, miRNA-celgenan prognozon, komentadon kaj esprimanalizon. Altnivela analizo ebligas personecigitan miRNA-serĉon kaj eltiron, Venn-diagramgeneradon, miRNA kaj celgenan retokonstruadon.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS estas tuta genoma re-sekvenca analizplatformo, kiu estas evoluigita surbaze de riĉa sperto en Biomarker Technologies. Ĉi tiu facile uzebla platformo permesas rapidan prezenton de integra analiza laborfluo simple fiksante kelkajn bazajn parametrojn, kiuj taŭgas por DNA-sekvencaj datumoj generitaj de kaj Illumina-platformo kaj BGI-sekvenca platformo. Ĉi tiu platformo estas deplojita sur alt-efikeca komputika servilo, kiu ebligas tre efikan datuman analizon en tre limigita tempo. Personigita datuma minado estas havebla surbaze de norma analizo, inkluzive de mutaciita gen-demando, PCR-enkonduka dezajno, ktp.
-
mRNA (referenco)
Transcriptome estas la ligo inter genomaj genetikaj informoj kaj la proteomo de biologia funkcio. Transkripcinivela reguligo estas la plej grava kaj la plej vaste studita reguliga maniero de organismoj. Transcriptome-sekvencado povas sekvenci la transkriptomon en ajna momento aŭ sub ajna kondiĉo, kun rezolucio preciza al ununura nukleotido. Ĝi povas dinamike reflekti la nivelon de gentransskribo, samtempe identigi kaj kvantigi maloftajn kaj normalajn transskribaĵojn, kaj disponigi la strukturajn informojn de specimeno specifaj transskribaĵoj.
Nuntempe, transcriptome-sekvenca teknologio estis vaste uzata en agronomio, medicino kaj aliaj esplorkampoj, inkluzive de besta kaj planto-disvolva reguligo, media adapto, imuna interago, gena lokalizo, specio-genetika evoluo kaj tumoro kaj genetika malsano-detekto.
-
Metagenomics (NGS)
Ĉi tiu analiza platformo estas desegnita por ĉaspafilo metagenomic-datunalizo surbaze de jaroj da sperto. Ĝi konsistas integra laborfluo enhavanta diversajn de komune bezonataj metagenomics analizoj inkluzive de datumtraktado, specio-nivelaj studoj, genfunkcio-nivelaj studoj, metagenombinning, ktp. Krome, personecigitaj datumminadaj iloj estas haveblaj sur norma analiza laborfluo, inkluzive de geno- kaj speciodemando. , parametra agordo, personigita figuro generado, ktp.
-
LncRNA
Longaj ne-kodaj RNAoj (lncRNA) estas speco de transskribaĵoj kun longo pli longa ol 200 nt, kiuj estas nekapablaj kodi proteinojn. Akumula indico indikas ke la plej multaj el lncRNAoj estas tre verŝajne funkciaj. Alt-rendimentaj sekvencaj teknologioj kaj bioinformadaj analizaj iloj rajtigas nin malkaŝi lncRNA-sekvencojn kaj poziciigi informojn pli efike kaj konduki nin malkovri lncRNA-ojn kun decidaj reguligaj funkcioj. BMKCloud fieras provizi niajn klientojn lncRNA-sekvencan analizan platformon por atingi rapidan, fidindan kaj flekseblan analizon de lncRNA.
-
GWAS
Genaro-kovranta asocio-studo (GWAS) celas identigi genetikajn variaĵojn (genotipo) kiuj asociis kun specifaj trajtoj (fenotipo). GWA-studoj esploras genetikajn signojn transiras tutan genaron de granda nombro da individuoj kaj antaŭdiras gentip-fenotipajn unuiĝojn per statistika analizo sur populacionivelo. Tutgenoma resekvencado eble povas malkovri ĉiujn genetikajn variaĵojn. Kunliĝante kun fenotipaj datenoj, GWAS povas esti prilaborita por identigi fenotipaj rilatajn SNPojn, QTLojn kaj kandidatajn genojn, kiuj forte subtenas modernan besto-/planto-reproduktadon. SLAF estas mem-evoluinta simpligita genarsekvenca strategio, kiu malkovras genar-kovrantajn distribuitajn signojn, SNP. Tiuj SNPoj, kiel molekulaj genetikaj signoj, povas esti prilaboritaj por asociostudoj kun laŭcelaj trajtoj. Ĝi estas kostefika strategio en identigado de kompleksaj trajtoj asociitaj genetikaj varioj.
-
Nanopore Plenlonga transcriptomics
Kompleksaj kaj variaj alternativaj izoformoj en organismoj estas gravaj genetikaj mekanismoj por reguligado de genekspresio kaj proteindiverseco. Preciza identigo de transskribaĵstrukturoj estas la bazo por profunda studo de genesprimaj reguligaj padronoj. Nanopora sekvenca platformo sukcese alportis transcriptomic studon al izoform-nivelo. Ĉi tiu analiza platformo estas dizajnita por analizi RNA-Seq-datenojn generitajn sur Nanopore-platformo surbaze de referenca genaro, kiu realigas kvalitajn kaj kvantajn analizojn en kaj gennivelo kaj transskribaĵnivelo.
-
cirk-RNA
Cirkla RNA (circRNA) estas speco de ne-kodiga RNA, kiu lastatempe estas trovita ludas decidan rolon en reguligaj retoj implikitaj en evoluado, media rezisto, ktp. Distinge de liniaj RNA-molekuloj, ekz. mRNA, lncRNA, 3′ kaj 5′ finoj de circRNA estas kunigitaj por formi cirklan strukturon, kiuj savas ilin de digestado de eksonukleazo kaj estas pli stabilaj ol la plej granda parto de lineara RNA. CircRNA estis trovita havi diversajn funkciojn en reguligado de genekspresio. CircRNA povas rezulti kiel ceRNA, kiu ligas miRNA konkurencive, konata kiel miRNA-spongo. CircRNA-sekvenca analiza platformo rajtigas circRNA-strukturon kaj esprimanalizon, celprognozon kaj komunan analizon kun aliaj specoj de RNA-molekuloj
-
BSA
Bulked Segregant Analysis-platformo konsistas el unupaŝa norma analizo kaj altnivela analizo kun personigita parametra agordo. BSA estas tekniko utiligita por rapide identigi fenotipaj rilatajn genetikajn signojn. Ĉefa laborfluo de BSA enhavas: 1. elektante du grupojn de individuoj kun ekstreme kontraŭaj fenotipoj; 2. kunigi la DNA, RNA aŭ SLAF-seq (Disvolvita de Biomarker) de ĉiuj individuoj por formi du plejparton de DNA; 3. identigante diferencigajn sekvencojn kontraŭ referenca genaro aŭ intere, 4. antaŭdiri kandidatojn ligitajn regionojn per ED kaj SNP-indeksa algoritmo; 5. Funkcia analizo kaj pliriĉigo pri genoj en kandidataj regionoj, ktp. Pli altnivela minado en datumoj inkluzive de genetika markilo kaj enkonduka dezajno ankaŭ estas disponeblaj.
-
Amplikono (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platformo estas evoluigita kun jaroj da sperto en mikroba diverseca projekta analizo, kiu enhavas normigitan bazan analizon kaj personigitan analizon: baza analizo kovras la ĉefan analizan enhavon de nuna mikroba esplorado, la analiza enhavo estas riĉa kaj ampleksa, kaj analizrezultoj estas prezentitaj en formo de projektraportoj; La enhavo de personigita analizo estas diversa. Specimenoj povas esti elektitaj kaj parametroj povas esti fiksitaj flekseble laŭ la baza analiza raporto kaj esplora celo, por realigi personecigitajn postulojn. Vindoza operaciumo, simpla kaj rapida.
-
Evolua Genetiko
Evolua Genetiko estas ampleksa sekvenca servo dizajnita por oferti kompreneman interpreton de la evoluo ene de granda grupo de individuoj, surbaze de genetikaj varioj, inkluzive de SNPoj, InDels, SVoj kaj CNVoj. Ĉi tiu servo ampleksas ĉiujn esencajn analizojn necesajn por klarigi la evoluajn ŝanĝojn kaj genetikajn trajtojn de populacioj, inkluzive de taksoj de populaciostrukturo, genetika diverseco kaj filogenetikaj rilatoj. Krome, ĝi enprofundiĝas en studojn pri genfluo, ebligante taksojn de efika loĝantargrandeco kaj diverĝtempo. Evolugenetikaj studoj donas valorajn sciojn pri la originoj kaj adaptiĝoj de specioj.
Ĉe BMKGENE, ni ofertas du vojojn por fari evoluajn genetikajn studojn sur grandaj populacioj: utiligi tutgenaran sekvencon (WGS) aŭ elektante reduktitan reprezentan genarsekvencan metodon, la endome evoluigita Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF). Dum WGS konvenas pli malgrandajn genarojn, SLAF aperas kiel kostefika alternativo por studado de pli grandaj populacioj kun pli longaj genaroj, efike minimumigante sekvencikostojn.
