mRNA-seq (NGS) kun referenca genomo
RNA-seq estas norma ilo tra vivo kaj rikoltaj sciencoj, pliigante la interspacon inter genomoj kaj proteomoj. Ĝia forto kuŝas en malkovri novajn transskribaĵojn kaj kvantigi ilian esprimon en unu provo. Ĝi estas vaste uzata por komparaj transkriptomaj studoj, elverŝante lumon sur genoj rilataj al diversaj trajtoj aŭ fenotipoj, kiel kompari mutantojn al sovaĝaj tipoj aŭ malkaŝi genan esprimon en specifaj kondiĉoj. BMKCloud mRNA (referenca) app integras esprimon kvantigon, diferencan esprimon-analizon (deg), kaj sekvenca strukturo analizas en la mRNA-seq (NGS) bioinformatika dukto kaj amalgamas la fortojn de simila programaro, certigante komforton kaj uzanton. Uzantoj povas alŝuti siajn RNA-seq-datumojn al la nubo, kie la app ofertas kompletan, unufojan bioinforman analizan solvon. Aldone, ĝi prioritatas klientan sperton, ofertante personecajn operaciojn adaptitajn al la specifaj bezonoj de uzantoj. Uzantoj povas agordi parametrojn kaj sendi la dukto -mision per si mem, kontroli la interagan raporton, vidi datumojn/diagramojn kaj kompletigi datumminadon, kiel: celan genan elekton, funkcian grupigon, diagramadon, ktp.
Platformo:Illumina, MGI
Strategio:RNA-seq
Aranĝo: Pariita, pura-datuma.
Biblioteko Tipo:fr-unstranded, fr-furststrand aŭ fr-sekundstrand
Legu longon:150 BP
Dosiera tipo:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz aŭ *.fq.gz. La sistemo farosaŭtomate parigu la .fastq -dosierojn laŭ iliaj nomoj,ekz. *_1.fastq parigita kun *._ 2.fastq.
Nombro de specimenoj:Ne estas limigoj pri la nombrode specimenoj, sed la analiza tempo pliiĝos dum la nombro despecimenoj kreskas.
Rekomendita datuma kvanto:6g per specimeno