Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Novaĵoj

Genomo

Nature_Communications_logo

Kromosoma-skala asembleo kaj analizo de biomasa rikolto miscanthus lutarioriparius genomo

Nanopore -sekvenco | Illumina | Hi-C | RNA-Sekvencado | Filogenio

En ĉi tiu studo, Biomarker Technologies provizis teknikan subtenon pri Nanopore-sekvenco, de novo-genoma asembleo, Hi-C Helpata Asembleo, ktp.

Abstrakta

Miscanthus, rizomata perena planto, havas grandan potencialon por bioenergia produktado por sia alta biomaso kaj streĉa toleremo. Ni raportas kromosom-skalan asembleon deMiscanthus LutarioripariusGenomo kombinante Oxford Nanopore-sekvencon kaj HI-C-teknologiojn. La 2.07-GB-asembleo kovras 96.64% de la genomo, kun Contig N50 de 1.71 MB. La centromeraj kaj telomeraj sekvencoj estas kunvenigitaj por ĉiuj 19 kromosomoj kaj kromosomo 10 respektive. Allotetraploida origino de la M. lutarioriparius estas konfidita uzante centromerajn satelitajn ripetojn. La tetraploida genoma strukturo kaj pluraj kromosomaj reordigoj rilate al sorgo estas klare pruvitaj. Tandemaj duplikataj genoj deM. Lutarioripariusestas funkciaj riĉigitaj ne nur en terminoj rilataj al streĉa respondo, sed ĉela muro -biosintezo. Genaj familioj rilataj al malsana rezisto, ĉela muro -biosintezo kaj metala jona transporto estas tre vastigitaj kaj evoluintaj. La ekspansio de ĉi tiuj familioj eble estas grava genoma bazo por plibonigo de rimarkindaj trajtoj deM. Lutaririoprius.

Ŝlosila statistiko de genoma asembleo

Novaĵoj-1
Novaĵoj-2

Figuro. Superrigardo de la genoma asembleo de M. lutarioriparius

Novaĵoj kaj elstaraĵoj Celas dividi la plej novajn sukcesajn kazojn kun biomarkaj teknologioj, kapti novajn sciencajn atingojn same kiel elstarajn teknikojn aplikitajn dum la studo.


Afiŝotempo: Jan-05-2022

Sendu vian mesaĝon al ni: