Metagenomiko (NGS)

Pafila metagenomiko kun Illumina estas populara ilo por studi mikrobiomojn rekte sekvencante DNA de kompleksaj specimenoj, ebligante la studadon de kaj taksonomia kaj funkcia diverseco. La dukto de BMKCloud-metagenomika (NGS) komenciĝas per kvalito-kontrolo kaj metagenoma asembleo, el kiu genoj estas antaŭdiritaj kaj alkroĉitaj al ne-redundaj datumaroj, kiuj estas komentitaj por funkcio kaj taksonomio uzante multoblajn datumbazojn. Ĉi tiu informo estas uzata por analizi ene de specimenaj taksonomiaj diversecoj (alfa diverseco) kaj inter-specimenaj diversecoj (beta-diverseco). Diferenca analizo inter grupoj trovas OTUojn kaj biologiajn funkciojn, kiuj diferencas inter la du grupoj uzante ambaŭ parametrajn kaj ne-parametrikajn provojn, dum korelacia analizo rilatas ĉi tiujn diferencojn al mediaj faktoroj.