Genoma-larĝa asocio-analizo
Laborfluo
Servaj avantaĝoj
●Ampleksaj kompetentecoj kaj publikigaj registroj: Kun akumulita sperto en GWAS, BMKGENE kompletigis centojn da specioj -projektoj en populacio GWAS -esplorado, helpis esploristojn eldoni pli ol 100 artikolojn, kaj la akumula efika faktoro atingis 500.
● Ampleksa bioinformatika analizo: Laborfluo inkluzivas SNP-Traitan Asocion-Analizon, liverante aron da kandidataj genoj kaj ilian respondan funkcian komentaron.
●Tre lerta bioinformatika teamo kaj mallonga analiza ciklo: Kun bonega sperto pri altnivela genomika analizo, la teamo de BMKGENE liveras ampleksajn analizojn kun rapida tempodaŭro.
●Post-venda subteno:Nia devontigo etendas preter projekt-kompletigo kun 3-monata post-venda servo-periodo. Dum ĉi tiu tempo, ni ofertas sekvadon de projektoj, problemojn pri helpo, kaj Q & A-sesioj por trakti iujn ajn demandojn rilatajn al la rezultoj.
Servaj Specifoj kaj Postuloj
| Speco de sinsekvo | Rekomendita Populara Skalo | Sekvenca Strategio | Nukleotidaj postuloj |
| Tuta genoma sinsekvo | 200 specimenoj | 10x | Koncentriĝo: ≥ 1 ng/ µl Tuta kvanto≥ 30ng Limigita aŭ neniu degenero aŭ poluado |
| Specif-Locus Amplified Fragment (SLAF) | Etikeda profundo: 10x Nombro de etikedoj: <400 MB: WGS rekomendas <1GB: 100k -etikedoj 1GB > 2GB: 300k -etikedoj Maksimume 500k -etikedoj | Koncentriĝo ≥ 5 ng/µl Tuta kvanto ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 Agarosa ĝelo: neniu aŭ limigita degenero aŭ poluado
|
Materia elekto
Malsamaj Varioj, Subspecioj, Landoj/Genebankoj/Miksitaj Familioj/Sovaĝaj Rimedoj
Malsamaj varioj, subspecioj, tegmentoj
Duon-sib-familio/plen-sib-familio/sovaĝaj rimedoj
Serva laborfluo
Eksperimenta Dezajno
Ekzempla liverado
RNA -eltiro
Biblioteko -Konstruado
Sekvenco
Datuma Analizo
Post-vendaj servoj
Inkluzivas la jenan analizon:
- Genoma-larĝa asocio-analizo: LM, LMM, Emmax, Fastlmm Model
- Funkcia komentario de kandidataj genoj
SNP-Trait Association Analysis-Manhatana Intrigo
SNP-Trait Association Analysis-QQ-intrigo
Esploru la progresojn faciligitajn de De Gwas -servoj de BMKGENE per komisiita kolekto de publikaĵoj:
LV, L. et al. (2023) 'Enrigardo pri la genetika bazo de amonia toleremo en razilo clam sinonovacula constricta per genoma larĝa asocio-studo',Akvokulturo, 569, p. 739351. Doi: 10.1016/j.aquaculture.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Multi-ujaj analizoj de 398 Foxtail Millet-aliroj malkaŝas genomajn regionojn asociitajn kun malsovaĝigo, metabolaj trajtoj kaj kontraŭinflamaj efikoj',Molekula planto, 15 (8), pp 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Genoma-larĝa asocio mapado de hulless apenaŭ fenotipoj en sekeca medio',Limoj en plantoscienco, 13, p. 924892. Doi: 10.3389/fpls.2022.924892/bibtex.
Zhao, X. et al. (2021) 'GMST1, kiu kodas sulfotransferase, donas reziston al sojfabaj mozaikaj virusaj streĉoj G2 kaj G3',Planto, ĉelo kaj medio, 44 (8), pp 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
