Eŭkariota mRNA Sequencing-NGS
Karakterizaĵoj
● Kapto de polimRNA antaŭ biblioteka preparado
● Laŭvola direkta mRNA-biblioteka preparo por ebligi akiri faden-specifajn sekvencdatenojn
● Bioinformatika analizo de gena esprimo kaj transskriba strukturo
Avantaĝoj
●Vasta Sperto: Nia teamo prilaboris pli ol 600,000 specimenojn ĉe BMKgene, ampleksante diversajn specimenspecojn kiel ĉelkulturojn, histojn kaj korpaj fluidojn. Ni alportas multe da sperto al ĉiu projekto kaj sukcese kompletigis pli ol 100,000 mRNA-Seq-projektojn en diversaj esploraj domajnoj.
●Rigora Kvalita Kontrolo: Ni efektivigas kernajn kontrolpunktojn tra ĉiuj stadioj, de specimena kaj biblioteka preparo ĝis sekvencado kaj bioinformadiko. Ĉi tiu zorgema monitorado certigas la liveron de konstante altkvalitaj rezultoj, certigante al vi, ke via projekto estas en fidindaj manoj.
●Ampleksa Komentario: Ni uzas plurajn datumbazojn por funkcie komenti la Diferenci Esprimitajn Genojn (DEG) kaj fari respondajn riĉigajn analizojn. Ĉi tiu ampleksa aliro disponigas sciojn pri la ĉelaj kaj molekulaj procezoj sub la transcriptoma respondo, certigante ke vi estas plene informita pri la rezultoj de via projekto.
●Postvenda Subteno: Nia devontigo etendiĝas preter la kompletiĝo de la projekto kun 3-monata post-venda servoperiodo. Dum ĉi tiu tempo, ni ofertas projektan sekvadon, helpon pri solvo de problemoj kaj sesiojn pri demandoj kaj respondoj por trakti demandojn rilate al la rezultoj.
Specimenaj Postuloj kaj Livero
| Biblioteko | Sekvenca strategio | Datenoj rekomenditaj | Kvalita Kontrolo |
| Poly A riĉigita | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 Gb | Q30≥85% |
Ekzemplaj Postuloj:
Nukleotidoj:
| Konk. (ng/μl) | Kvanto (μg) | Pureco | Integreco | |
| Norma Biblioteko | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limigita aŭ neniu proteino aŭ DNA-poluado montrita sur ĝelo. | Por plantoj: RIN≥4.0; Por bestoj: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; limigita aŭ neniu bazlinia alteco |
| Direkta Biblioteko | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limigita aŭ neniu proteino aŭ DNA-poluado montrita sur ĝelo. | Por plantoj: RIN≥4.0; Por bestoj: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; limigita aŭ neniu bazlinia alteco |
● Plantoj:
Radiko, Tigo aŭ Petalo: 450 mg
Folio aŭ Semo: 300 mg
Frukto: 1,2 g
●Besto:
Koro aŭ Intesto: 300 mg
Intestoj aŭ Cerbo: 240 mg
Muskolo: 450 mg
Ostoj, Haro aŭ Haŭto: 1g
● Artropodoj:
Insektoj: 6 g
Krustacoj: 300 mg
● Tuta sango: 1 tubo
● Ĉeloj: 106 ĉeloj
Rekomendita Specimena Livero
Ujo: 2 ml centrifuga tubo (Stana folio ne rekomendas)
Ekzempla etikedado: Grupo+replikato ekz. A1, A2, A3; B1, B2, B3... ...
Sendado:
1. Seka glacio: Specimenoj devas esti pakitaj en sakoj kaj enterigitaj en seka glacio.
2. RNAs-tablotuboj: RNA-provaĵoj povas esti sekigitaj en RNA-stabiliga tubo (ekz. RNAstable®) kaj senditaj en ĉambra temperaturo.
Serva Laborfluo
Eksperimenta dezajno
Specimena livero
RNA-eltiro
Biblioteka konstruado
Sekvencado
Analizo de datumoj
Post-vendaj servoj
Bioinformadiko
Eŭkariota mRNA-sekvenca analiza laborfluo
Bioinformadiko
ØKontrolo de kvalito de krudaj datumoj
ØReferenca genaro vicigo
ØAnalizo de transskriba strukturo
ØKvantigo de esprimo
ØDiferenciala esprimo analizo
ØFunkcia komentario kaj riĉigo
Referenco Genome Alignment
Saturado de datumoj
Specimena korelacio kaj taksado de biologiaj kopioj
Diference Esprimitaj Genoj (DEGoj)
Funkcia Komentario de DEGs
Funkcia Riĉigo de DEGoj
Esploru la progresojn faciligitaj de la eŭkariotaj NGS-mRNA-sekvencaj servoj de BMKGene per vikariita kolekto de publikaĵoj.
Huang, L. et al. (2023) "Triclosan kaj triclocarban malfortigas la flarkapaciton de orfiŝo limigante odoran rekonon, interrompante flara signaltransdukton kaj ĝenante flaran informpretigon", Water Research, 233, p. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) "Aspergillus fumigatus kaperas homan p11 por redirekti fung-enhavantajn fagosomojn al ne-degrada vojo", Cell Host & Microbe, 31 (3), pp 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'TCP-Transcription Factors Involved in Shoot Development of Ma Bamboo (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, p. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) "La Chrysanthemum lavandulifolium genaro kaj la molekula mekanismo suba diversaj kapitulumspecoj", Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) "Kaskada nanoreaktoro por plibonigado de sonodinamika terapio sur kolorekta kancero per sinergia ROS-pliigo kaj aŭtofagia blokado", Nano Today, 49, p. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
