Platformo | Biblioteko Grandeco | Teoriaj Datumoj -rendimento (per ĉelo) | Unu-baza precizeco | Aplikoj |
Nanopore | 8KB, 10KB, 20KB, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90GB/Ĉelo | 85-92% | SV-alvoko, de novo, plenlonga sekvenco, ISO-seq, gena komentario, detekto de DNA-metilado |
● Pli ol 5 -jara sperto pri Pacbio -sekvenca platformo kun miloj da fermitaj projektoj kun diversaj specioj.
● BMKGENE estas oficiala partnero de Oxford Nanopore, kun duala platformo RNA/DNA -atestilo.
● Estas ĉefaj modeloj de sekvencistoj kun kompleta ekipaĵo kaj sufiĉa sekvenca fluo.
● Surbaze de la nanopore -platformo, pli ol 10 esploroj pri besto kaj planto deveno estis publikigitaj en internacie famaj revuoj.
Ekzempla tipo | Kvanto | Koncentriĝo (Qubit ®) | Volumo | Pureco | Aliaj |
Genomika DNA | Dependas de datuma postulo | ≥20ng/µl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.2; OD260/230≥1.5 ; Klara pinto je 260 nm , neniuj poluoj | Koncentriĝo bezonas esti mezurita per qubit kaj qubit/nanopore ≤ 2 |
Tuta RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/µl | ≥15μl | OD260/280 = 1.7-2.5; OD260/230 = 0,5-2,5 ; Neniuj poluoj | RIN -valoro ≥7.5 |
Taksado de Datuma Kvalito de DNA -Specimeno
Tabelo 1. Statistikoj pri puraj datumoj.
Bmkid | rawseqnum | rawsumbase | Cleanseqnum | Cleansumbase | Cleann50len | Cleann90len | CleanMeanlen | CleanMaxlen | CleanMeAnqual |
DNA_BMK01 | 1.218.239 | 26.37 | 1.121.736 | 25.90 | 28,014 | 15.764 | 23,090 | 143.181 | 9 |
Takso de Datuma Kvalito de RNA -Specimeno
Tabelo 1. Statistikoj pri puraj datumoj.
Dosiernomo | KlientoID | Readnum | Basenum | N50 | Meznombro | MaxLength | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8.947.708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129.227 | Q12 |
Figuro 1. Legu longan distribuon
Figuro 2. Kvalita poentara distribuo de puraj datumoj
Figuro 3. Longo kaj Kvalita Poentada Distribuo de Puraj Datumoj