CircRNA Sequencing-Illumina
Karakterizaĵoj
● rRNA-malplenigo sekvita de direkta biblioteka preparo, ebligante faden-specifajn sekvencdatenojn.
● Bioinformatika laborfluo ebligas circRNA-antaŭdiron kaj espriman kvantigon
Servaj Avantaĝoj
●Pli Ampleksaj RNA-Bibliotekoj:Ni uzas rRNA-malplenigon anstataŭ linia RNA-malplenigo en nia antaŭbiblioteka preparo, certigante ke la sekvencaj datumoj inkluzivas ne nur circRNA sed ankaŭ mRNA kaj lncRNA, ebligante komunan analizon de ĉi tiuj datumaroj.
●Laŭvola Analizo de Konkurenciva Endogena RNA (ceRNA) Retoj: Provizante pli profundajn komprenojn pri ĉelaj reguligaj mekanismoj
●Vasta Sperto: Kun rekordo pri prilaborado de pli ol 20,000 specimenoj ĉe BMKGENE, ampleksante diversajn specimenspecojn kaj lncRNA-projektojn, nia teamo alportas riĉecon da sperto al ĉiu projekto.
●Rigora Kvalita Kontrolo: Ni efektivigas kernajn kontrolpunktojn tra ĉiuj stadioj, de specimena kaj biblioteka preparo ĝis sekvencado kaj bioinformadiko. Ĉi tiu zorgema monitorado certigas la liveron de konstante altkvalitaj rezultoj.
● Post-venda Subteno: Nia devontigo etendiĝas preter la kompletiĝo de la projekto kun 3-monata post-venda servoperiodo. Dum ĉi tiu tempo, ni ofertas projektan sekvadon, helpon pri solvo de problemoj kaj sesiojn pri demandoj kaj respondoj por trakti demandojn rilate al la rezultoj.
Specimenaj Postuloj kaj Livero
| Biblioteko | Platformo | Rekomenditaj datumoj | Datumoj QC |
| rRNA elĉerpita direkta biblioteko | Illumina PE150 | 16-20 Gb | Q30≥85% |
Ekzemplaj Postuloj:
Nukleotidoj:
| Konk. (ng/μl) | Kvanto (μg) | Pureco | Integreco |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Limigita aŭ neniu proteino aŭ DNA-poluado montrita sur ĝelo. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; limigita aŭ neniu bazlinia alteco |
● Plantoj:
Radiko, Tigo aŭ Petalo: 450 mg
Folio aŭ Semo: 300 mg
Frukto: 1,2 g
● Besto:
Koro aŭ Intesto: 450 mg
Intestoj aŭ Cerbo: 240 mg
Muskolo: 600 mg
Ostoj, Haro aŭ Haŭto: 1,5 g
● Artropodoj:
Insektoj: 9 g
Krustacoj: 450 mg
● Tuta sango:2 tuboj
● Ĉeloj: 106 ĉeloj
● Serumo kaj Plasmo: 6 ml
Rekomendita Specimena Livero
Ujo: 2 ml centrifuga tubo (Stana folio ne rekomendas)
Ekzempla etikedado: Grupo+replikato ekz. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Sendado:
1. Seka glacio: Specimenoj devas esti pakitaj en sakoj kaj enterigitaj en seka glacio.
2. RNAstable-tuboj: RNA-provaĵoj povas esti sekigitaj en RNA-stabiliga tubo (ekz., RNAstable®) kaj senditaj ĉe ĉambra temperaturo.
Serva Laborfluo
Eksperimenta dezajno
Specimena livero
RNA-eltiro
Biblioteka konstruado
Sekvencado
Analizo de datumoj
Post-vendaj servoj
Bioinformadiko
circRNA-prognozo: kromosoma distribuo
Differentially Expressed circRNAs - Vulkanintrigo
Differentially Expressed circRNAs - hierarkia grupigo
Funkcia riĉigo de la mastro-genoj de circRNA
Esploru la esplorajn progresojn faciligitaj de la circRNA-sekvencaj servoj de BMKGene per vikariita kolekto de publikaĵoj.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 reguligas circRNA-formadon kaj mikroRNA-mediaciitan genan silentigon en hepatoĉela karcinomo', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), pp 4338-4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) "X oo-respondema transcriptome rivelas la rolon de la cirkla RNA133 en malsanrezisto per reguligado de esprimo de OsARAB en rizo", Phytopathology Research, 5 (1), pp 1-14. doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et al. (2023) "CPSF3 modulas la ekvilibron de cirklaj kaj liniaj transskribaĵoj en hepatoĉela karcinomo". doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al. (2023) "Ampleksa taksado de circRNAs en ciroza kardiomiopatio antaŭ kaj post hepata transplantado", Internacia Imunfarmakologio, 114, p. 109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
