16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-GNS
Servaj Trajtoj
● Sekvenca Platformo: Illumina Novaseq.
● Amplekso de mallongaj regionoj de 16s, 18s kaj ĝiaj, inter aliaj amplifaj celoj.
● Flekseblaj elektoj de amplikono.
● Antaŭa projekto -sperto kun multnombraj amplifaj celoj.
Servaj avantaĝoj
●Izolita sen:Rapida identigo de mikrobiaj kunmetaĵoj en mediaj specimenoj.
●Alta Rezolucio: En malalt-abundaj komponentoj en mediaj specimenoj.
●Vaste aplikebla: Diversaj mikrobaj komunumaj studoj.
●Kompleta bioinformata analizo: La plej nova pakaĵo QiiMe2 (kvanta kompreno pri mikrobiana ekologio) kun diversaj analizoj koncerne datumbazon, komentaron, OTU/ASV.
●Vasta kompetenteco: Kun projektoj de sekvencado de 150 mil amplikonoj faritaj ĉiujare, BMKGENE alportas pli ol jardekon da sperto, tre lertan analizan teamon, ampleksan enhavon kaj bonegan post-vendan subtenon.
Servaj Specifoj
| Biblioteko | Sekvenca Strategio | Datumoj Rekomenditaj |
| Amplicon | Illumina PE250 | 50/100/300k etikedoj (legu parojn) |
Servaj Postuloj
| Koncentriĝo (ng/µL) | Tuta kvanto (NG) | Volumo (µL) |
| ≥1 | ≥200 | ≥20 |
● Grundo/ŝlimo: 1-2g
● Intestina Enhavo-Animalo: 0,5-2g
● Intesta Enhavo-Insekto: 0.1-0.25g
● Planta surfaco (riĉigita sedimento): 0,1-0,5g
● Fermenta buljono riĉigita sedimento): 0.1-0.5g
● fekoj (grandaj bestoj): 0,5-2g
● Faeces (muso): 3-5grajnoj
● pulma alveola lavita fluido: filtrila papero
● Vagina swab: 5-6 ŝvitoj
● Haŭta/genitala swab/saliva/buŝa mola histo/faringea swab/rektala swab: 2-3 svingoj
● Surfacaj mikroorganismoj: filtrila papero
● Akvodomo/aero/biofilmo: filtrila papero
● Endofitoj: 1-2g
● Dentala plako: 0,5-1g
Serva laborfluo
Ekzempla liverado
Biblioteko -Konstruado
Sekvenco
Datuma Analizo
Post-vendaj servoj
Inkluzivas la jenan analizon:
- Kruda datumkvalita kontrolo
- OTU-grupigo /de-bruo (ASV)
- OTU -Komentario
- Analizo de Alfa Diverseco: Multoblaj Indeksoj, inkluzive de Shannon, Simpson kaj ACE.
- Beta -diversa analizo
- Intergrupa analizo
- Korelacia Analizo: Inter Mediaj Faktoroj kaj Ekstera Kunmetaĵo kaj Diverseco
- 16S funkcia gena prognozo
Histogramo de taksonomia distribuo
Taksonomia abundo grupigas varmegan mapon
Analizo de Alfa Diverseco: Malofta Kurbo
Beta -diverseca analizo: NMDS
Intergrupa Analizo: Malkovro de Lefse Biomarker
Esploru la progresojn faciligitajn de la Amplicon -sekvencaj servoj de BMKGene kun Illumina per komisiita kolekto de publikaĵoj.
Dong, C. et al. (2022) 'Asembleo, Kerna Mikrobiota, kaj Funkcio de la Rhizosfera Grundo kaj Bark Microbiota en Eucommia Ulmoides', Limoj en Mikrobiologio, 13. DOI: 10.3389/FMICB.2022.855317/plena.
Li, Y. et al. (2023) 'Sinteza bakteria konsorcia transplantado por la traktado de bakteria vaginosis induktita de Gardnerella vaginalis en musoj', mikrobiomo, 11 (1), pp 1-14. doi: 10.1186/s40168-023-01497-y
Yang, J., Fu, Y. kaj Liu, H. (2022) 'Mikrobiomoj de aera polvo kolektitaj dum la terena fermita bioregenera vivsubtena eksperimento "Luna Palaco 365", Mediaj Mikrobiomoj, 17 (1), pp. 1–20. doi: 10.1186/s40793-022-00399-0/ciferoj/8.
Yin, S. et al. (2022) 'Feedstock-dependa abundo de funkciaj genoj rilataj al nitrogen-transformo kontrolita nitrogenperdo en kompostado', Bioresource-teknologio, 361, p. 127678. Doi: 10.1016/j.biortech.2022.127678.
