Ολόκληρη η μεταγραφική αλληλουχία - Illumina
Χαρακτηριστικά
● Διπλή βιβλιοθήκη για να ακολουθήσει το πλήρες μεταγραφικό στοιχείο: εξάντληση rRNA ακολουθούμενη από προετοιμασία βιβλιοθήκης PE150 και επιλογή μεγέθους ακολουθούμενη από προετοιμασία βιβλιοθήκης SE50
● Πλήρης ανάλυση βιοπληροφορικής του mRNA, του lncRNA, του circRNA και του miRNA σε ξεχωριστές εκθέσεις βιοπληροφορικής
● Ανάλυση κοινής ανάλυσης όλων των έκφρασης RNA σε μια συνδυασμένη αναφορά, συμπεριλαμβανομένης της ανάλυσης CERNA Networks.
Πλεονεκτήματα υπηρεσίας
●Εμπεριστατωμένη ανάλυση των ρυθμιστικών δικτύων: Η ανάλυση του δικτύου CERNA ενεργοποιείται από την κοινή αλληλουχία του mRNA, του lncRNA, του circRNA και του miRNA και από μια εξαντλητική βιοπληροφορική ροή εργασίας.
●Περιεκτικός σχολιασμός: Χρησιμοποιούμε πολλαπλές βάσεις δεδομένων για να σχολιάσουμε λειτουργικά τα διαφορικά εκφρασμένα γονίδια (DEGs) και να εκτελέσουμε την αντίστοιχη ανάλυση εμπλουτισμού, παρέχοντας πληροφορίες για τις κυτταρικές και μοριακές διεργασίες που αποτελούν τη βάση της ανταπόκρισης του μεταγραφικού.
●Εκτεταμένη τεχνογνωσία: Με ένα ιστορικό επιτυχώς κλείνοντας πάνω από 2100 ολόκληρα μεταγραφικά έργα σε διάφορους ερευνητικούς τομείς, η ομάδα μας φέρνει μια πλούσια εμπειρία σε κάθε έργο.
●Αυστηρός ποιοτικός έλεγχος: Εφαρμόζουμε βασικά σημεία ελέγχου σε όλα τα στάδια, από την προετοιμασία του δείγματος και της βιβλιοθήκης έως την αλληλουχία και τη βιοπληροφορική. Αυτή η σχολαστική παρακολούθηση εξασφαλίζει την παράδοση σταθερά αποτελέσματα υψηλής ποιότητας.
●Υποστήριξη μετά την πώληση: Η δέσμευσή μας εκτείνεται πέρα από την ολοκλήρωση του έργου με μια περίοδο υπηρεσίας μετά την πώληση 3 μηνών. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, προσφέρουμε παρακολούθηση έργων, βοήθεια αντιμετώπισης προβλημάτων και συνεδρίες Q & A για την αντιμετώπιση τυχόν ερωτήσεων που σχετίζονται με τα αποτελέσματα
Απαιτήσεις δείγματος και παράδοση
| Βιβλιοθήκη | Στρατηγική προσδιορισμού αλληλουχίας | Συνιστώμενα δεδομένα | Ποιοτικός έλεγχος |
| rRNA εξαντλημένο | Illumina PE150 | 16 GB | Q30≥85% |
| Επιλεγμένο μέγεθος | Illumina SE50 | 10-20m διαβάζει |
Απαιτήσεις δείγματος:
Νουκλεοτίδια:
| (Ng/μL) | Ποσό (μg) | Καθαρότητα | Ακεραιότητα |
| ≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0.5-2.5 Περιορισμένη ή καθόλου μόλυνση πρωτεΐνης ή ϋΝΑ που εμφανίζεται σε πήκτωμα. | Rin ≥6,0 5.0≥28S/18S≥1,0; περιορισμένη ή καθόλου βασική ανύψωση |
Συνιστώμενη παράδοση δείγματος
Δοχείο: 2 ml φυγοκεντρικού σωλήνα (δεν συνιστάται φύλλο κασσίτερου)
Δείγμα επισήμανσης: Ομάδα+αντιγραφή π.χ. Α1, Α2, Α3. Β1, Β2, Β3.
Αποστολή:
1. Dry-I-ICE: Τα δείγματα πρέπει να συσκευάζονται σε σακούλες και να ταφούν σε ξηρό πάγο.
2. Οι σωλήνες RNATable: δείγματα RNA μπορούν να ξηραίνονται σε σωλήνα σταθεροποίησης RNA (π.χ. RNastable®) και να αποσταλούν σε θερμοκρασία δωματίου.
Ροή εργασίας
Σχεδιασμός πειραματισμού
Δειγματοληψία
Εκχύλιση RNA
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Προσδιορισμός αλληλουχίας
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
Βιοπληροφορική
Επισκόπηση έκφρασης RNA
Διαφορικά εκφρασμένα γονίδια
ανάλυση CERNA
Διαφορικά εκφρασμένα miRNAs και συναφή RNAs
Εξερευνήστε τις ερευνητικές εξελίξεις που διευκολύνεται από τις υπηρεσίες αλληλουχίας του BMKGENE 'ολόκληρο το μεταγραφικό προσδιορισμό αλληλουχίας μέσω μιας επιμελημένης συλλογής δημοσιεύσεων.
Dai, Υ. Et αϊ. (2022) «Περιεκτικά προφίλ έκφρασης των mRNAs, lncRNAs και miRNAs σε ασθένεια Kashin-Beck που προσδιορίζεται με αλληλουχία RNA», Molecular Omics, 18 (2), σελ. 154-166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, Ν. Nan et αϊ. (2022) «Ανάλυση πλήρους μήκους μεταγραφής της αντοχής στο κρύο του APIS Cerana στο βουνό Changbai κατά τη διάρκεια της περιόδου υπερέδρου», Gene, 830, σελ. 146503-146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et αϊ. (2022) «Παρουσιάστε την ιεράρχηση των ανταγωνιστικών ενδογενών δικτύων ρύθμισης του ενδογενούς RNA σε καρκίνο του πνεύμονα μικρών κυττάρων: μοριακά χαρακτηριστικά και υποψήφιους φαρμάκων, Frontiers inCology, 12, σ. 904865. Doi: 10.3389/fonc.2022.904865/bibtex.
Xu, Ρ. Et αϊ. (2022) «Ολοκληρωμένη ανάλυση των προφίλ έκφρασης lncRNA/circrna-miRNA-mRNA αποκαλύπτει νέες γνώσεις σε δυνητικούς μηχανισμούς σε απόκριση νηματωδών ρίζας-κόμβου στο φυστίκι», BMC Genomics, 23 (1), σελ. 1-12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/σχήματα/7.
Yan, Z. et αϊ. (2022) «Η αλληλούχιση του RNA ολικής μεταγραφής υπογραμμίζει τους μοριακούς μηχανισμούς που σχετίζονται με τη διατήρηση της ποιότητας μετά την συγκομιδή στο μπρόκολο με την ακτινοβολία Red LED», τη βιολογία και την τεχνολογία μετά τη συγκομιδή, 188, σ. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.111878.
