Μικρή αλληλουχία RNA-illumina
Χαρακτηριστικά
● Η προετοιμασία της βιβλιοθήκης περιλαμβάνει ένα βήμα επιλογής μεγέθους
● Η βιοπληροφορική ανάλυση επικεντρώνεται γύρω από την πρόβλεψη του miRNA και τους στόχους τους
Πλεονεκτήματα υπηρεσίας
●Περιεκτική ανάλυση βιοπληροφορικής:Επιτρέποντας την ταυτοποίηση τόσο των γνωστών όσο και των νέων miRNAs, την ταυτοποίηση των στόχων miRNAs και την αντίστοιχη λειτουργική σχολιασμό και εμπλουτισμό με πολλαπλές βάσεις δεδομένων (KEGG, GO)
●Αυστηρός ποιοτικός έλεγχος: Εφαρμόζουμε βασικά σημεία ελέγχου σε όλα τα στάδια, από την προετοιμασία του δείγματος και της βιβλιοθήκης έως την αλληλουχία και τη βιοπληροφορική. Αυτή η σχολαστική παρακολούθηση εξασφαλίζει την παράδοση σταθερά αποτελέσματα υψηλής ποιότητας.
●Υποστήριξη μετά την πώληση: Η δέσμευσή μας εκτείνεται πέρα από την ολοκλήρωση του έργου με μια περίοδο υπηρεσίας μετά την πώληση 3 μηνών. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, προσφέρουμε την παρακολούθηση του έργου, την αντιμετώπιση προβλημάτων βοήθειας και τις συνεδρίες Q & A για την αντιμετώπιση τυχόν ερωτήσεων που σχετίζονται με τα αποτελέσματα.
●Εκτεταμένη τεχνογνωσία: Με ένα ιστορικό επιτυχώς κλείνοντας σε πολλά έργα srna που καλύπτουν πάνω από 300 είδη σε διάφορους ερευνητικούς τομείς, η ομάδα μας φέρνει μια πλούσια εμπειρία σε κάθε έργο.
Απαιτήσεις δείγματος και παράδοση
| Βιβλιοθήκη | Πλατφόρμα | Συνιστώμενα δεδομένα | Δεδομένα QC |
| Επιλεγμένο μέγεθος | Illumina SE50 | 10m-20m διαβάζει | Q30≥85% |
Απαιτήσεις δείγματος:
Νουκλεοτίδια:
| (Ng/μL) | Ποσό (μg) | Καθαρότητα | Ακεραιότητα |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0.5-2.5 Περιορισμένη ή καθόλου μόλυνση πρωτεΐνης ή ϋΝΑ που εμφανίζεται σε πήκτωμα. | Rin ≥6,0; 5.0≥28S/18S≥1,0; περιορισμένη ή καθόλου βασική ανύψωση |
● Φυτά:
Ρίζα, στέλεχος ή πέταλο: 450 mg
Φύλλο ή σπόρος: 300 mg
Φρούτα: 1,2 g
● Ζώο:
Καρδιά ή έντερο: 450 mg
Σπλάχνα ή εγκέφαλο: 240 mg
Μυς: 600 mg
Οστά, μαλλιά ή δέρμα: 1,5 γραμμάρια
● Αρθρόποδα:
Έντομα: 9g
Crustacea: 450 mg
● Ολόκληρο το αίμα: 2 σωλήνες
● Κύτταρα: 106 κελιά
● ορός και πλάσμα:6 mL
Συνιστώμενη παράδοση δείγματος
Δοχείο: 2 ml φυγοκεντρικού σωλήνα (δεν συνιστάται φύλλο κασσίτερου)
Δείγμα επισήμανσης: Ομάδα+αντιγραφή π.χ. Α1, Α2, Α3. Β1, Β2, Β3.
Αποστολή:
1. Dry-I-ICE: Τα δείγματα πρέπει να συσκευάζονται σε σακούλες και να ταφούν σε ξηρό πάγο.
2. Οι σωλήνες RNABLE: Τα δείγματα RNA μπορούν να στεγνώσουν σε σωλήνα σταθεροποίησης RNA (π.χ. RNastable®) και να αποστέλλονται σε θερμοκρασία δωματίου.
Ροή εργασίας
Σχεδιασμός πειραματισμού
Δειγματοληψία
Εκχύλιση RNA
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Προσδιορισμός αλληλουχίας
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
Βιοπληροφορική
● Έλεγχος ποιότητας δεδομένων ακατέργαστων δεδομένων
● ταξινόμηση srna
● Ευθυγράμμιση σε γονιδίωμα αναφοράς
● Ταυτοποίηση γνωστού και νέου miRNA
● Ανάλυση διαφορικής έκφρασης miRNA
● Λειτουργικός σχολιασμός στόχων miRNA
Ταυτοποίηση του miRNA: δομή και βάθος
Διαφορική έκφραση του miRNA - Hiearchical ομαδοποίηση
Λειτουργικός σχολιασμός του στόχου των διαφορικά εκφρασμένων miRNAs
Εξερευνήστε τις ερευνητικές εξελίξεις που διευκολύνεται από τις υπηρεσίες αλληλουχίας SRNA του BMKGENE μέσω μιας επιμελημένης συλλογής δημοσιεύσεων.
Chen, Η. Et αϊ. (2023) «Οι ιογενείς λοιμώξεις αναστέλλουν τη βιοσύνθεση σαπωνίνης και τη φωτοσύνθεση στο Panax Notoginseng, τη φυσιολογία και τη βιοχημεία των φυτών, 203, σ. 108038. Doi: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, Η. Et αϊ. (2023) «Η πρωτεΐνη 1 που περιέχει την περιοχή Fyve με συστατικά με μικροεπεξεργαστή για να καταστείλει τη βιογένεση του miRNA», EMBO αναφορές, 24 (1). doi: 10.15252/Emb.202255037/suppl_file/entm202255037-sup-0004-sdatafig4.tif.
Yu, J. et αϊ. (2023) 'Η microRNA AME-BANTAM-3P ελέγχει την προνύμφη ανάπτυξης του νεογέννητου, στοχεύοντας τους πολλαπλούς επιφανειακούς τομείς που μοιάζουν με τον αυξητικό παράγοντα. . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Zhang, Μ. Et αϊ. (2018) «Η ολοκληρωμένη ανάλυση του miRNA και των γονιδίων που σχετίζονται με την ποιότητα του κρέατος αποκαλύπτει ότι το GGA-MIR-140-5P επηρεάζει την ενδομυϊκή εναπόθεση λίπους στα κοτόπουλα», την κυτταρική φυσιολογία και τη βιοχημεία, 46 (6), σελ. 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.
