Τα μικρά RNAs είναι τύπος μικρού μη κωδικοποιημένου RNA με μέσο μήκος 18-30 nt, συμπεριλαμβανομένου του miRNA, του siRNA και του pIRNA. Αυτά τα μικρά RNAs έχουν αναφερθεί μαζικά ότι εμπλέκονται σε διάφορες βιολογικές διεργασίες όπως η αποικοδόμηση του mRNA, η αναστολή της μετάφρασης, ο σχηματισμός ετεροχρωματίνης κλπ. Η ανάλυση αλληλουχίας μικρού SmallRNA έχει εφαρμοστεί ευρέως σε μελέτες σχετικά με την ανάπτυξη ζώων/φυτών, ασθένειας, ιού κλπ. Μικρό RNA Η πλατφόρμα ανάλυσης αλληλουχίας αποτελείται από τυπική ανάλυση και προηγμένη εξόρυξη δεδομένων. Στη βάση των δεδομένων RNA-Seq, η τυπική ανάλυση μπορεί να επιτύχει την ταυτοποίηση και την πρόβλεψη του miRNA, την πρόβλεψη του γονιδίου στόχου, τον σχολιασμό και την ανάλυση της έκφρασης. Η προηγμένη ανάλυση επιτρέπει την προσαρμοσμένη αναζήτηση και εκχύλιση miRNA, την παραγωγή διαγράμματος Venn, το miRNA και την οικοδόμηση δικτύου γονιδίου στόχου.