
Μικρό RNA
Τα μικρά RNA είναι σύντομα μη κωδικοποιητικά RNA με μέσο μήκος 18-30 nt, συμπεριλαμβανομένων των miRNA, siRNA και piRNA, τα οποία παίζουν σημαντικό ρόλο στις ρυθμιστικές διαδικασίες. Ο αγωγός sRNA BMKCloud παρέχει τυπική και προσαρμοσμένη ανάλυση για την αναγνώριση miRNA. Μετά την περικοπή ανάγνωσης και τον ποιοτικό έλεγχο, οι αναγνώσεις ευθυγραμμίζονται με πολλαπλές βάσεις δεδομένων για την ταξινόμηση sRNA και επιλογή miRNA και χαρτογραφούνται στο γονιδίωμα αναφοράς. Τα miRNA προσδιορίζονται με βάση γνωστές βάσεις δεδομένων miRNA, παρέχοντας πληροφορίες για τη δευτερογενή δομή, την οικογένεια miRNA και τα γονίδια-στόχους. Η ανάλυση διαφορικής έκφρασης προσδιορίζει διαφορικά εκφραζόμενα miRNAs και τα αντίστοιχα γονίδια-στόχοι σχολιάζονται λειτουργικά για την εύρεση εμπλουτισμένων κατηγοριών.
Ροή εργασιών βιοπληροφορικής
