-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Η χωρική μεταγραφική βρίσκεται στην πρώτη γραμμή της επιστημονικής καινοτομίας, δίνοντας τη δυνατότητα στους ερευνητές να εμβαθύνουν σε περίπλοκα πρότυπα γονιδιακής έκφρασης εντός των ιστών, διατηρώντας παράλληλα το χωρικό τους πλαίσιο. Ανάμεσα σε διάφορες πλατφόρμες, η BMKGene έχει αναπτύξει το BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, το οποίο διαθέτει βελτιωμένη ανάλυση 3,5 μm, φθάνει το υποκυτταρικό εύρος και επιτρέπει ρυθμίσεις ανάλυσης πολλαπλών επιπέδων. Το τσιπ S3000, που διαθέτει περίπου 4 εκατομμύρια σημεία, χρησιμοποιεί μικροπηγάδια με στρώματα με σφαιρίδια φορτωμένα με ανιχνευτές σύλληψης με χωρικό γραμμικό κώδικα. Μια βιβλιοθήκη cDNA, εμπλουτισμένη με χωρικούς γραμμικούς κώδικες, προετοιμάζεται από το τσιπ S3000 και στη συνέχεια προσδιορίζεται η αλληλουχία στην πλατφόρμα Illumina NovaSeq. Ο συνδυασμός δειγμάτων με χωρική γραμμωτό κώδικα και UMI διασφαλίζει την ακρίβεια και την ειδικότητα των δεδομένων που παράγονται. Το τσιπ BMKManu S3000 είναι εξαιρετικά ευέλικτο, προσφέροντας ρυθμίσεις ανάλυσης πολλαπλών επιπέδων που μπορούν να ρυθμιστούν με ακρίβεια σε διαφορετικούς ιστούς και επιθυμητά επίπεδα λεπτομέρειας. Αυτή η προσαρμοστικότητα τοποθετεί το τσιπ ως εξαιρετική επιλογή για ποικίλες χωρικές μεταγραφικές μελέτες, διασφαλίζοντας ακριβή χωρική ομαδοποίηση με ελάχιστο θόρυβο. Η χρήση της τεχνολογίας τμηματοποίησης κυττάρων με το BMKManu S3000 επιτρέπει την οριοθέτηση των μεταγραφικών δεδομένων στα όρια των κυττάρων, με αποτέλεσμα μια ανάλυση που έχει άμεσο βιολογικό νόημα. Επιπλέον, η βελτιωμένη ανάλυση του S3000 έχει ως αποτέλεσμα υψηλότερο αριθμό γονιδίων και UMI που ανιχνεύονται ανά κύτταρο, επιτρέποντας μια πολύ πιο ακριβή ανάλυση των μοτίβων χωρικής μεταγραφής και ομαδοποίησης των κυττάρων.
-
Προκατασκευασμένες βιβλιοθήκες DNBSEQ
Το DNBSEQ, που αναπτύχθηκε από την MGI, είναι μια καινοτόμος τεχνολογία NGS που έχει καταφέρει να μειώσει περαιτέρω το κόστος αλληλουχίας και να αυξήσει την απόδοση. Η προετοιμασία των βιβλιοθηκών DNBSEQ περιλαμβάνει κατακερματισμό DNA, προετοιμασία ssDNA και ενίσχυση κυλιόμενου κύκλου για τη λήψη των νανομπάλες DNA (DNB). Αυτά στη συνέχεια φορτώνονται σε μια στερεά επιφάνεια και στη συνέχεια προσδιορίζονται η αλληλουχία τους με συνδυαστική Σύνθεση Ανιχνευτή-Άγκυρας (cPAS). Η τεχνολογία DNBSEQ συνδυάζει τα πλεονεκτήματα του χαμηλού ποσοστού σφάλματος ενίσχυσης με τη χρήση μοτίβων σφάλματος υψηλής πυκνότητας με νανομπάλες, με αποτέλεσμα την αλληλουχία με υψηλότερη απόδοση και ακρίβεια.
Η προκατασκευασμένη υπηρεσία αλληλουχίας βιβλιοθηκών μας δίνει τη δυνατότητα στους πελάτες να προετοιμάσουν βιβλιοθήκες αλληλουχίας Illumina από διαφορετικές πηγές (mRNA, ολόκληρο γονιδίωμα, αμπλικόνιο, βιβλιοθήκες 10x, μεταξύ άλλων), οι οποίες μετατρέπονται σε βιβλιοθήκες MGI στα εργαστήριά μας για αλληλουχία στο DNBSEQ-T7, επιτρέποντας υψηλές ποσότητες δεδομένων με χαμηλότερο κόστος.
-
Αλληλεπίδραση χρωματίνης με βάση Hi-C
Το Hi-C είναι μια μέθοδος που έχει σχεδιαστεί για να καταγράφει τη γονιδιωματική διαμόρφωση συνδυάζοντας αλληλεπιδράσεις που βασίζονται στην εγγύτητα ανίχνευσης και αλληλουχία υψηλής απόδοσης. Η μέθοδος βασίζεται στη διασύνδεση χρωματίνης με φορμαλδεΰδη, ακολουθούμενη από πέψη και επανασύνδεση με τρόπο που μόνο θραύσματα που είναι ομοιοπολικά συνδεδεμένα θα σχηματίζουν προϊόντα απολίνωσης. Με τον προσδιορισμό της αλληλουχίας αυτών των προϊόντων απολίνωσης, είναι δυνατό να μελετηθεί η τρισδιάστατη οργάνωση του γονιδιώματος. Το Hi-C επιτρέπει τη μελέτη της κατανομής των τμημάτων του γονιδιώματος που είναι ελαφρώς συσκευασμένα (διαμερίσματα Α, ευχρωματίνη) και είναι πιο πιθανό να είναι μεταγραφικά ενεργά, και των περιοχών που είναι πιο σφιχτά συσκευασμένα (διαμερίσματα Β, Ετεροχρωματίνη). Το Hi-C μπορεί επίσης να χρησιμοποιηθεί για τον εντοπισμό Τοπολογικά Συνδεδεμένων Τομέων (TADs), περιοχών του γονιδιώματος που έχουν διπλωμένες δομές και είναι πιθανό να έχουν παρόμοια μοτίβα έκφρασης και για τον εντοπισμό βρόχων χρωματίνης, περιοχών DNA που είναι αγκυρωμένες μεταξύ τους από πρωτεΐνες και που είναι συχνά εμπλουτίζεται σε ρυθμιστικά στοιχεία. Η υπηρεσία αλληλουχίας Hi-C της BMKGene δίνει τη δυνατότητα στους ερευνητές να εξερευνήσουν τις χωρικές διαστάσεις της γονιδιωματικής, ανοίγοντας νέους δρόμους για την κατανόηση της ρύθμισης του γονιδιώματος και τις επιπτώσεις της στην υγεία και τις ασθένειες.
-
Kit Smart Magnetic Plant RNA TGuide
Kit Smart Magnetic Plant RNA TGuide
Καθαρίστε υψηλής ποιότητας ολικό RNA από φυτικούς ιστούς
-
TGuide Έξυπνο κιτ RNA αίματος/κυττάρων/ιστών
TGuide Έξυπνο κιτ RNA αίματος/κυττάρων/ιστών
Το προγεμισμένο κιτ αντιδραστηρίου φυσιγγίων/πλάκας για καθαρισμό ολικού RNA υψηλής απόδοσης, υψηλής καθαρότητας, υψηλής ποιότητας, χωρίς αναστολείς από ζωικό ιστό/κύτταρο/φρέσκο ολικό αίμα
-
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
Καθαρίστε υψηλής ποιότητας γονιδιωματικό DNA από διάφορους φυτικούς ιστούς
-
TGuide Smart Soil / Stool DNA Kit
TGuide Smart Soil / Stool DNA Kit
Καθαρίζει το DNA χωρίς αναστολείς υψηλής καθαρότητας και ποιότητας από δείγματα εδάφους και κοπράνων
-
Κιτ καθαρισμού TGuide Smart DNA
Ανακτά DNA υψηλής ποιότητας από προϊόν PCR ή τζελ αγαρόζης.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Το προγεμισμένο κιτ αντιδραστηρίων φυσιγγίων/πλάκας για καθαρισμό γονιδιωματικού DNA από αίμα και φλεγμονή
-
TGuide Smart Magnetic Tissue DNA Kit
Το προγεμισμένο κιτ αντιδραστηρίου φυσιγγίων/πλάκας για εξαγωγή γονιδιωματικού DNA από ζωικούς ιστούς
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Το προγεμισμένο κιτ αντιδραστηρίου φυσιγγίων/πλάκας για τον καθαρισμό του γονιδιωματικού DNA από αίμα, αποξηραμένα σημεία αίματος, βακτήρια, κύτταρα, σάλιο, στοματικά επιχρίσματα, ζωικούς ιστούς κ.λπ.
-
Εκχυλιστής νουκλεϊκών οξέων TGuide S16
Εκχυλιστής νουκλεϊκών οξέων TGuide S16
Εύκολο στη χρήση όργανο πάγκου, 1-8 ή 16 δείγματα ταυτόχρονα
Αριθμός καταλόγου / συσκευασία
Γάτα. Όχι
ID
Αριθμός προετοιμασιών
ΟΣΕ-Σ16-ΑΜ
1 σετ
-
Διάλυμα mRNA πλήρους μήκους PacBio 2+3
Ενώ η αλληλουχία mRNA που βασίζεται στο NGS είναι ένα ευέλικτο εργαλείο για τον ποσοτικό προσδιορισμό της γονιδιακής έκφρασης, η εξάρτησή του από σύντομες αναγνώσεις περιορίζει την αποτελεσματικότητά του σε σύνθετες μεταγραφικές αναλύσεις. Από την άλλη πλευρά, η αλληλούχιση PacBio (Iso-Seq) χρησιμοποιεί τεχνολογία μακράς ανάγνωσης, επιτρέποντας τον προσδιορισμό της αλληλουχίας μεταγραφών mRNA πλήρους μήκους. Αυτή η προσέγγιση διευκολύνει μια ολοκληρωμένη διερεύνηση εναλλακτικού ματίσματος, συντήξεων γονιδίων και πολυ-αδενυλίωσης, αν και δεν είναι η κύρια επιλογή για τον ποσοτικό προσδιορισμό της γονιδιακής έκφρασης. Ο συνδυασμός 2+3 γεφυρώνει το χάσμα μεταξύ Illumina και PacBio βασιζόμενος στις αναγνώσεις HiFi του PacBio για τον προσδιορισμό του πλήρους συνόλου των ισομορφών μεταγραφής και της αλληλουχίας NGS για την ποσοτικοποίηση των πανομοιότυπων ισομορφών.
Πλατφόρμες: PacBio Sequel II/ PacBio Revio και Illumina NovaSeq;
