Μεταγραφικό πλήρους μήκους Pacbio

Η αλληλουχία μεταγραφικού πλήρους μήκους PACBIO, ISOSEQ, επιτρέπει την ακριβή ταυτοποίηση ισομορφών μεταγραφής, ρίχνοντας φως στην εναλλακτική πολυαδενυλίωση και ματίσματος και οδηγώντας σε ακριβέστερη ανάλυση γονιδιακής έκφρασης. Ο αγωγός πλήρους μήκους BMKCloud PACBIO πλήρους μήκους έχει σχεδιαστεί για να αναλύει τις βιβλιοθήκες cDNA που αλληλουχιζόμενες σε λειτουργία κυκλικής συναίνεσης (CCS) και προσδιορίζουν τις μη-χιμαιρικές αλληλουχίες πλήρους μήκους (FLNC), οι οποίες στη συνέχεια συγκεντρώνονται σε μη ανακατασκευασμένες μεταγραφές. Μια επακόλουθη ανάλυση BUSCO αξιολογεί την πληρότητα της συναρμολόγησης του μεταγραφικού. Από το συναρμολογημένο μεταγραφικό στοιχείο, εκτελούνται πολλαπλές αναλύσεις: εναλλακτική ματίσματος, επανάληψη απλής αλληλουχίας (SSR), πρόβλεψη του lncRNA και αντίστοιχα γονίδια στόχου, πρόβλεψη νέων γονιδίων, ανάλυση γονιδιακής οικογένειας, ανάλυση μεταγραφής και λειτουργική σχολιασμός των μεταγραφών.