Γονιδίωμα

Συναρμολόγηση και ανάλυση και ανάλυση του γονιδιώματος Biomass Crop Miscanthus Lutarioriparius Lutarioriparius
Η αλληλουχία νανοπόρων | Illumina | HI-C | RNA-αλληλουχία | Φιλογένεια
Σε αυτή τη μελέτη, οι τεχνολογίες Biomarker παρείχαν τεχνική υποστήριξη για την αλληλουχία νανοπορικών, τη συναρμολόγηση De Novo, το HI-C υποβοηθούμενο συνέλευση κ.λπ.
Περίληψη
Εσφαλμένος, ένα ριζομάριο πολυετές φυτό, έχει μεγάλες δυνατότητες για την παραγωγή βιοενέργειας για την υψηλή ανοχή της βιομάζας και του στρες. Αναφέρουμε μια συναρμολόγηση χρωμοσωμάτωνMiscanthus lutarioripariusγονιδίωμα συνδυάζοντας την αλληλουχία νανοπορικών της Οξφόρδης και τις τεχνολογίες HI-C. Το συγκρότημα 2.07-GB καλύπτει το 96,64% του γονιδιώματος, με contig N50 1,71 Mb. Οι αλληλουχίες κεντρομερούς και τελομερών συναρμολογούνται για όλα τα 19 χρωμοσώματα και το χρωμόσωμα 10, αντίστοιχα. Η αλλοτετραπευτική προέλευση του Μ. Lutarioriparius επιβεβαιώνεται χρησιμοποιώντας κεντρομερή δορυφορικά επαναλήψεις. Η δομή του τετραπλοειδούς γονιδιώματος και αρκετές χρωμοσωμικές αναδιατάξεις σε σχέση με το σόργο αποδεικνύονται σαφώς. Διπλά διπλά γονίδια τουΜ. Lutarioripariusείναι λειτουργικοί εμπλουτισμένοι όχι μόνο με όρους που σχετίζονται με την ανταπόκριση του στρες, αλλά και τη βιοσύνθεση των κυτταρικών τοιχωμάτων. Οι γονιδιακές οικογένειες που σχετίζονται με την αντίσταση των ασθενειών, τη βιοσύνθεση των κυτταρικών τοιχωμάτων και τη μεταφορά μεταλλικών ιόντων επεκτείνονται σε μεγάλο βαθμό και εξελίσσονται. Η επέκταση αυτών των οικογενειών μπορεί να είναι μια σημαντική γονιδιωματική βάση για την ενίσχυση των αξιοσημείωτων χαρακτηριστικών τουΜ. Lutarioriparius.
Βασικά στατιστικά στοιχεία της συναρμολόγησης γονιδιώματος


Εικόνα. Επισκόπηση της συναρμολόγησης γονιδιώματος M. lutarioriparius
Νέα και στιγμιότυπα Σκοπός στοχεύει στην ανταλλαγή των τελευταίων επιτυχημένων περιπτώσεων με τεχνολογίες βιοδεικτών, καταγράφοντας νέα επιστημονικά επιτεύγματα καθώς και εξέχουσες τεχνικές που εφαρμόστηκαν κατά τη διάρκεια της μελέτης.
Χρόνος δημοσίευσης: Ιαν-05-2022