Οι σύνθετες και μεταβλητές εναλλακτικές ισομορφές στους οργανισμούς είναι σημαντικοί γενετικοί μηχανισμοί για τη ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης και της ποικιλομορφίας των πρωτεϊνών. Η ακριβής αναγνώριση των δομών μεταγραφής είναι η βάση για την εις βάθος μελέτη των μοντέλων ρύθμισης της γονιδιακής έκφρασης. Η πλατφόρμα προσδιορισμού αλληλουχίας νανοπορίας έχει φέρει με επιτυχία μεταγραφική μελέτη σε ισομορφικό επίπεδο. Αυτή η πλατφόρμα ανάλυσης έχει σχεδιαστεί για να αναλύει τα δεδομένα RNA-Seq που παράγονται στην πλατφόρμα νανοπόρων στη βάση του γονιδιώματος αναφοράς, η οποία επιτυγχάνει ποιοτικές και ποσοτικές αναλύσεις τόσο σε επίπεδο γονιδίων όσο και σε επίπεδο μεταγραφών.
