Μετατόπιση αλληλουχίας
Χαρακτηριστικά υπηρεσίας
● Εξάντληση rRNA ακολουθούμενη από προετοιμασία κατεύθυνσης mRNA.
● Ανεξάρτητα από την Illumina Novaseq.
Πλεονεκτήματα υπηρεσίας
●Μελετήστε τις αλλαγές σύνθετων μικροβιακών κοινοτήτων:Αυτό συμβαίνει στο μεταγραφικό επίπεδο και διερευνά τα πιθανά νέα γονίδια.
●Εξηγώντας αλληλεπιδράσεις μικροβιακής κοινότητας με τον οικοδεσπότη ή το περιβάλλον.
●Ολοκληρωμένη βιοπληροφορική ανάλυση: Αυτό παρέχει πληροφορίες σχετικά με τις κοινοτικές ταξινομικές και λειτουργικές συνθέσεις, καθώς και την ανάλυση διαφορικής γονιδιακής έκφρασης.
●Εκτεταμένος σχολιασμός γονιδίων:Χρησιμοποιώντας ενημερωμένες βάσεις δεδομένων γονιδιακής λειτουργίας για ενημερωτικές πληροφορίες γονιδιακής έκφρασης των μικροβιακών κοινοτήτων.
●Υποστήριξη μετά την πώληση:Η δέσμευσή μας εκτείνεται πέρα από την ολοκλήρωση του έργου με μια περίοδο υπηρεσίας μετά την πώληση 3 μηνών. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, προσφέρουμε την παρακολούθηση του έργου, την αντιμετώπιση προβλημάτων βοήθειας και τις συνεδρίες Q & A για την αντιμετώπιση τυχόν ερωτήσεων που σχετίζονται με τα αποτελέσματα.
Προδιαγραφές υπηρεσίας
| Πλατφόρμα αλληλουχίας | Στρατηγική προσδιορισμού αλληλουχίας | Συνιστώμενα δεδομένα | Έλεγχος ποιότητας δεδομένων |
| Illumina Novaseq | PE150 | 12GB | Q30≥85% |
Απαιτήσεις δειγματοληψίας
| Συγκέντρωση (ng/μL) | Συνολικό ποσό (μg) | Όγκος (μL) | OD260/280 | OD260/230 | Ριπή |
| ≥50 | ≥1,0 | ≥20 | 1.8-2.0 | 1.0-2.5 | ≥6,5 |
Ροή εργασίας
Δειγματοληψία
Κατασκευή βιβλιοθήκης
Προσδιορισμός αλληλουχίας
Ανάλυση δεδομένων
Υπηρεσίες μετά την πώληση
Περιλαμβάνει την ακόλουθη ανάλυση:
● Έλεγχος ποιότητας δεδομένων αλληλουχίας
● Συγκρότημα μεταγραφής
● ταξινομικός σχολιασμός και αφθονία
● Λειτουργικός σχολιασμός και αφθονία
● Ποσοτικοποίηση έκφρασης και διαφορική ανάλυση
Ταξινομική κατανομή κάθε δείγματος:
Ανάλυση βήτα ποικιλομορφίας: UPGMA
Λειτουργικός σχολιασμός - Πηγαίνετε αφθονία
Διαφορική αφθονία ταξινόμησης - Lefse
Εξερευνήστε τις εξελίξεις που διευκολύνεται από τις υπηρεσίες αλληλουχίας Meta Transcriptomics της BMKGENE μέσω μιας επιμελημένης συλλογής δημοσιεύσεων.
LU, Ζ. Et αϊ. (2023) «Η ανοχή των οξέων των βακτηρίων που χρησιμοποιούν γαλακτικό άλατο της τάξης Bacteroidales συμβάλλει στην πρόληψη της ρουμινικής οξέωσης σε κατσίκες προσαρμοσμένες σε μια δίαιτα υψηλής συγκέντρωσης»,Ζωική διατροφή, 14, σελ. 130-140. doi: 10.1016/j.aninu.2023.05.006.
Τραγούδι, Z. et αϊ. (2017) «Η εξάπλωση του πυρήνα λειτουργικής μικροβιακής σε παραδοσιακή ζύμωση στερεάς κατάστασης με αμπλικόνια υψηλής απόδοσης και αλληλουχία μετατραγγίσματος»,Σύνορα στη μικροβιολογία, 8 (Ιουλ). doi: 10.3389/fmicb.2017.01294/πλήρης.
Wang, W. et αϊ. (2022) «Νέοι μυκοϊοί που ανακαλύφθηκαν από μια έρευνα Metatranscriptomics για τον μύκητα Phytopathogogenic Alternaria»,Ιοί, 14 (11), σελ. 2552. Doi: 10.3390/v14112552/s1.
Wei, J. et αϊ. (2022) «Η παράλληλη ανάλυση του μετατραγγίμιου αποκαλύπτει την αποικοδόμηση των δευτερογενών μεταβολιτών των φυτών από τα σκαθάρια και τα συμβόλια του εντέρου»,Μοριακός Οικολογία, 31 (15), σελ. 3999-4016. doi: 10.1111/mec.16557.
