lncrna

Τα μακρά μη κωδικοποιητικά RNA (lncRNA) είναι RNA μεγαλύτερα από 200 νουκλεοτίδια με χαμηλό δυναμικό κωδικοποίησης αλλά με κρίσιμες ρυθμιστικές λειτουργίες. Ο αγωγός BMKCloud lncRNA έχει σχεδιαστεί για να αναλύει βιβλιοθήκες με εξάντληση rRNA με ένα υψηλής ποιότητας, καλά σχολιασμένο γονιδίωμα αναφοράς, αναλύοντας την έκφραση lncRNA και mRNA μαζί. Μετά την ανάγνωση περικοπής και τον ποιοτικό έλεγχο, οι αναγνώσεις ευθυγραμμίζονται με το γονιδίωμα αναφοράς για τη συγκέντρωση μεταγραφών και η επακόλουθη ανάλυση γονιδιακής δομής αποκαλύπτει εναλλακτικό μάτισμα και νέα γονίδια. Τα μεταγραφήματα αναγνωρίζονται ως mRNA ή lncRNA και η ανάλυση διαφορικής έκφρασης προσδιορίζει διαφορικά εκφραζόμενα lncRNA, τους στόχους τους και τα διαφορικά εκφραζόμενα γονίδια (DEGS). Τόσο οι DEG όσο και οι διαφορικά εκφραζόμενοι στόχοι lncRNA σχολιάζονται λειτουργικά για την εύρεση εμπλουτισμένων λειτουργικών κατηγοριών.