Εξελικτική γενετική

Οι εξελικτικές γενετικές μελέτες στοχεύουν στην κατανόηση της εξελικτικής τροχιάς των πληθυσμών χρησιμοποιώντας πληροφορίες πολυμορφισμού σε γονιδιωματικές αλληλουχίες. Ο αγωγός Evolutionary Genetics BMKCloud έχει σχεδιαστεί για να αναλύει δεδομένα WGS ή ειδικού ενισχυμένου θραύσματος (SLAF) από μεγάλους πληθυσμούς. Μετά τον ποιοτικό έλεγχο των ακατέργαστων δεδομένων, οι αναγνώσεις ευθυγραμμίζονται με το γονιδίωμα αναφοράς και καλούνται οι παραλλαγές αναφοράς. Ο αγωγός περιλαμβάνει την κατασκευή φυλογενετικών δένδρων, την ανάλυση κύριων συστατικών (PCA), την ανάλυση της δομής του πληθυσμού, την ανισορροπία σύνδεσης (LD), την ανάλυση επιλεκτικής σάρωσης και την ανάλυση των υποψήφιων γονιδίων.