Προκατασκευασμένες βιβλιοθήκες DNBSEQ
Χαρακτηριστικά
●Πλατφόρμα:MGI-DNBSEQ-T7
●Λειτουργίες αλληλουχίας:PE150
●Μεταφορά βιβλιοθηκών Illumina σεMGI:επιτρέποντας την αλληλουχία των υψηλών όγκων δεδομένων με χαμηλό κόστος.
●Ποιοτικός έλεγχος των βιβλιοθηκών πριν από την αλληλουχία.
●Δεδομένα αλληλουχίας QC και παράδοση:Παράδοση της έκθεσης QC και των ακατέργαστων δεδομένων σε μορφή FASTQ μετά από αποφανειακά και φιλτράρισμα Q30 Reads.
Φόντα
●Ευελιξία των υπηρεσιών αλληλουχίας:Ο πελάτης μπορεί να επιλέξει να ακολουθήσει τη λωρίδα ή το ποσό των δεδομένων.
●Υψηλή έξοδος δεδομένων:1500 GB/λωρίδα
●Παράδοση της αναφοράς QC Sequencing:με μετρήσεις ποιότητας, ακρίβεια δεδομένων και συνολική απόδοση του έργου αλληλουχίας.
●Διαδικασία ώριμης αλληλουχίας:με σύντομο χρόνο περιστροφής.
●Αυστηρός ποιοτικός έλεγχος: Εφαρμόζουμε αυστηρές απαιτήσεις QC για να εξασφαλίσουμε την παράδοση σταθερά αποτελέσματα υψηλής ποιότητας.
Απαιτήσεις δειγματοληψίας
| Ποσό δεδομένων (x) | Συγκέντρωση (qpcr/nm) | Τόμος | |
| Μερική λωρίδα
| X ≤ 10 GB | ≥ 1nm | ≥ 25 μΐ |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μΐ | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μΐ | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ||
| Μονή λωρίδα | Ανά λωρίδα | ≥ 1,5 nm / πισίνα βιβλιοθήκης | ≥ 25 μΐ / πισίνα βιβλιοθήκης |
Εκτός από τη συγκέντρωση και τη συνολική ποσότητα, απαιτείται επίσης κατάλληλο πρότυπο κορυφής.
ΣΗΜΕΙΩΣΗ: Η αλληλουχία των βιβλιοθηκών χαμηλής ποικιλομορφίας απαιτεί το Phix Spike-in για να εξασφαλίσει ισχυρή βάση βάσης.
Συνιστούμε την υποβολή προ-πλεκτών βιβλιοθηκών ως δείγματα. Εάν χρειάζεστε το Bmkgene να εκτελέσει συγκέντρωση βιβλιοθήκης, ανατρέξτε στο
Απαιτήσεις βιβλιοθήκης για τη μερική αλληλουχία λωρίδων.
Μέγεθος βιβλιοθήκης (χάρτης αιχμής)
Η κύρια κορυφή θα πρέπει να είναι εντός 300-450 bp.
Οι βιβλιοθήκες θα πρέπει να έχουν μία μόνο κύρια κορυφή, χωρίς μόλυνση προσαρμογέα και χωρίς διμερή εκκινητή.
Ροή εργασίας
Βιβλιοθήκη QC αναφορά
Μια αναφορά σχετικά με την ποιότητα της βιβλιοθήκης παρέχεται πριν από την αλληλουχία, την αξιολόγηση του ποσού της βιβλιοθήκης και του κατακερματισμού.
Αναφορά αλληλουχίας QC
Πίνακας 1. Στατιστικά στοιχεία σχετικά με τα δεδομένα αλληλουχίας.
| Δειγμάτων ταυτότητα | Bmkid | RAW διαβάζει | Ακατέργαστα δεδομένα (BP) | Καθαρές αναγνώσεις (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Εικόνα 1. Διανομή ποιότητας κατά μήκος των αναγνώσεων σε κάθε δείγμα
Εικόνα 2. Διανομή περιεχομένου βάσης
Εικόνα 3. Κατανομή περιεχομένων ανάγνωσης σε δεδομένα αλληλουχίας
