Kleine RNA

Kleine RNAs sind kurze nichtkodierende RNAs mit einer durchschnittlichen Länge von 18–30 nt, einschließlich miRNA, siRNA und piRNA, die eine wichtige Rolle bei regulatorischen Prozessen spielen. Die BMKCloud-sRNA-Pipeline bietet sowohl Standard- als auch benutzerdefinierte Analysen zur miRNA-Identifizierung. Nach dem Trimmen der Lesevorgänge und der Qualitätskontrolle werden die Lesevorgänge mit mehreren Datenbanken abgeglichen, um sRNAs zu klassifizieren und miRNAs auszuwählen, und auf das Referenzgenom abgebildet. miRNAs werden auf der Grundlage bekannter miRNA-Datenbanken identifiziert und liefern Informationen zur Sekundärstruktur, miRNA-Familie und Zielgenen. Die Analyse der differentiellen Expression identifiziert unterschiedlich exprimierte miRNAs und die entsprechenden Zielgene werden funktionell annotiert, um angereicherte Kategorien zu finden.