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BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Die räumliche Transkriptomik steht an der Spitze der wissenschaftlichen Innovation und ermöglicht es Forschern, in komplexe Genexpressionsmuster innerhalb von Geweben einzutauchen und gleichzeitig deren räumlichen Kontext zu bewahren. Im Rahmen verschiedener Plattformen hat BMKGene den BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip entwickelt, der über eine verbesserte Auflösung von 3,5 µm verfügt, den subzellulären Bereich erreicht und mehrstufige Auflösungseinstellungen ermöglicht. Der S3000-Chip verfügt über etwa 4 Millionen Spots und verwendet Mikrowells, die mit Perlen bestückt sind, die mit räumlich mit Barcodes versehenen Einfangsonden beladen sind. Aus dem S3000-Chip wird eine mit räumlichen Barcodes angereicherte cDNA-Bibliothek erstellt und anschließend auf der Illumina NovaSeq-Plattform sequenziert. Die Kombination aus räumlich mit Barcodes versehenen Proben und UMIs gewährleistet die Genauigkeit und Spezifität der generierten Daten. Der BMKManu S3000-Chip ist äußerst vielseitig und bietet mehrstufige Auflösungseinstellungen, die fein auf verschiedene Gewebe und gewünschte Detailgrade abgestimmt werden können. Diese Anpassungsfähigkeit macht den Chip zu einer hervorragenden Wahl für verschiedene räumliche Transkriptomstudien und gewährleistet eine präzise räumliche Clusterbildung mit minimalem Rauschen. Der Einsatz der Zellsegmentierungstechnologie mit BMKManu S3000 ermöglicht die Eingrenzung von Transkriptionsdaten auf die Zellgrenzen, was zu einer Analyse mit direkter biologischer Bedeutung führt. Darüber hinaus führt die verbesserte Auflösung von S3000 zu einer höheren Anzahl erkannter Gene und UMIs pro Zelle, was eine viel genauere Analyse der räumlichen Transkriptionsmuster und der Clusterbildung von Zellen ermöglicht.
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Vorgefertigte DNBSEQ-Bibliotheken
DNBSEQ, entwickelt von MGI, ist eine innovative NGS-Technologie, die es geschafft hat, die Sequenzierungskosten weiter zu senken und den Durchsatz zu erhöhen. Die Vorbereitung von DNBSEQ-Bibliotheken umfasst die DNA-Fragmentierung, die Vorbereitung von ssDNA und die Rolling-Circle-Amplifikation, um die DNA-Nanoballs (DNB) zu erhalten. Diese werden dann auf eine feste Oberfläche geladen und anschließend durch kombinatorische Sonden-Anker-Synthese (cPAS) sequenziert. Die DNBSEQ-Technologie kombiniert die Vorteile einer niedrigen Amplifikationsfehlerrate mit der Verwendung von Fehlermustern mit hoher Dichte bei Nanokugeln, was zu einer Sequenzierung mit höherem Durchsatz und höherer Genauigkeit führt.
Unser vorgefertigter Bibliothekssequenzierungsservice ermöglicht es Kunden, Illumina-Sequenzierungsbibliotheken aus verschiedenen Quellen (mRNA, gesamtes Genom, Amplikon, 10x-Bibliotheken usw.) vorzubereiten, die in unseren Labors in MGI-Bibliotheken umgewandelt werden, um in DNBSEQ-T7 sequenziert zu werden hohe Datenmengen zu geringeren Kosten.
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Hi-C-basierte Chromatin-Interaktion
Hi-C ist eine Methode zur Erfassung der genomischen Konfiguration durch die Kombination von Sondierungs-Proximity-basierten Interaktionen und Hochdurchsatzsequenzierung. Die Methode basiert auf der Chromatinvernetzung mit Formaldehyd, gefolgt von der Verdauung und erneuten Ligation, sodass nur kovalent verknüpfte Fragmente Ligationsprodukte bilden. Durch die Sequenzierung dieser Ligationsprodukte ist es möglich, die 3D-Organisation des Genoms zu untersuchen. Hi-C ermöglicht die Untersuchung der Verteilung der Teile des Genoms, die leicht gepackt sind (A-Kompartimente, Euchromatin) und mit größerer Wahrscheinlichkeit transkriptionell aktiv sind, und der Regionen, die dichter gepackt sind (B-Kompartimente, Heterochromatin). Hi-C kann auch verwendet werden, um topologisch assoziierte Domänen (TADs) zu lokalisieren, Regionen des Genoms, die gefaltete Strukturen aufweisen und wahrscheinlich ähnliche Expressionsmuster aufweisen, und um Chromatinschleifen zu identifizieren, DNA-Regionen, die durch Proteine miteinander verankert sind oft angereichert mit regulatorischen Elementen. Der Hi-C-Sequenzierungsdienst von BMKGene ermöglicht Forschern die Erforschung der räumlichen Dimensionen der Genomik und eröffnet neue Wege zum Verständnis der Genomregulation und ihrer Auswirkungen auf Gesundheit und Krankheit.
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TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Reinigen Sie hochwertige Gesamt-RNA aus Pflanzengeweben
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TGuide Smart Blut-/Zell-/Gewebe-RNA-Kit
TGuide Smart Blut-/Zell-/Gewebe-RNA-Kit
Das vorgefüllte Kartuschen-/Platten-Reagenzienkit für die Reinigung von hochreiner, hochwertiger und inhibitorfreier Gesamt-RNA aus tierischem Gewebe/Zellen/frischem Vollblut
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TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
Reinigen Sie hochwertige genomische DNA aus verschiedenen Pflanzengeweben
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TGuide Smart Boden-/Hocker-DNA-Kit
TGuide Smart Boden-/Hocker-DNA-Kit
Reinigt hemmstofffreie DNA von hoher Reinheit und Qualität aus Boden- und Stuhlproben
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TGuide Smart DNA-Reinigungskit
Gewinnt hochwertige DNA aus PCR-Produkten oder Agarosegelen.
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TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Das vorgefüllte Kartuschen-/Platten-Reagenzienkit für die genomische DNA-Reinigung aus Blut und Buffy Coat
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TGuide Smart Magnetic Tissue DNA Kit
Das vorgefüllte Kartuschen-/Platten-Reagenzienkit für die genomische DNA-Extraktion aus tierischem Gewebe
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TGuide Smart Universal DNA Kit
Das vorgefüllte Kartuschen-/Platten-Reagenzienkit zur Reinigung genomischer DNA aus Blut, getrockneten Blutflecken, Bakterien, Zellen, Speichel, Mundabstrichen, tierischen Geweben usw.
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TGuide S16 Nukleinsäureextraktor
TGuide S16 Nukleinsäureextraktor
Einfach zu bedienendes Tischgerät, 1–8 oder 16 Proben gleichzeitig
Katalognummer/Verpackung
Katze. NEIN
ID
Anzahl der Vorbereitungen
OSE-S16-AM
1 Satz
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PacBio 2+3 Volllängen-mRNA-Lösung
Während die NGS-basierte mRNA-Sequenzierung ein vielseitiges Werkzeug zur Quantifizierung der Genexpression ist, schränkt die Abhängigkeit von kurzen Lesevorgängen ihre Wirksamkeit bei komplexen transkriptomischen Analysen ein. Andererseits nutzt die PacBio-Sequenzierung (Iso-Seq) die Long-Read-Technologie und ermöglicht die Sequenzierung von mRNA-Transkripten voller Länge. Dieser Ansatz ermöglicht eine umfassende Untersuchung von alternativem Spleißen, Genfusionen und Polyadenylierung, obwohl er nicht die primäre Wahl für die Quantifizierung der Genexpression ist. Die 2+3-Kombination schließt die Lücke zwischen Illumina und PacBio, indem sie sich auf PacBio HiFi-Lesevorgänge zur Identifizierung des vollständigen Satzes von Transkript-Isoformen und NGS-Sequenzierung zur Quantifizierung der identischen Isoformen stützt.
Plattformen: PacBio Sequel II/ PacBio Revio und Illumina NovaSeq;
