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Das Metabolom ist das Endprodukt des Genoms und besteht aus der Gesamtheit aller niedermolekularen Moleküle (Metaboliten) in einer Zelle, einem Gewebe oder einem Organismus. Ziel der Metabolomik ist es, ein breites Spektrum kleiner Moleküle im Zusammenhang mit physiologischen Reizen oder Krankheitszuständen zu messen. Metabolomik-Methoden lassen sich in zwei verschiedene Gruppen einteilen: nicht zielgerichtete Metabolomik, eine beabsichtigte umfassende Analyse aller messbaren Analyten in einer Probe, einschließlich chemischer Unbekannter, mittels GC-MS/LC-MS, und gezielte Metabolomik, die Messung definierter Gruppen chemisch charakterisierter und chemischer Substanzen biochemisch annotierte Metaboliten.