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Produkte

Sequenzierung des gesamten menschlichen Exoms

Die Sequenzierung des gesamten Exoms des Menschen (hWES) gilt weithin als kosteneffizienter und leistungsstarker Sequenzierungsansatz zur Lokalisierung krankheitsverursachender Mutationen. Obwohl Exons nur etwa 1,7 % des gesamten Genoms ausmachen, spielen sie eine entscheidende Rolle, indem sie das Profil der gesamten Proteinfunktionen direkt widerspiegeln. Bemerkenswert ist, dass sich im menschlichen Genom über 85 % der krankheitsbedingten Mutationen innerhalb der proteinkodierenden Regionen manifestieren. BMKGENE bietet einen umfassenden und flexiblen Service zur Sequenzierung des gesamten menschlichen Exoms mit zwei verschiedenen Strategien zur Exon-Erfassung, um verschiedene Forschungsziele zu erreichen.


Servicedetails

Demo-Ergebnisse

Servicefunktionen

● Zwei Exom-Panels verfügbar, basierend auf der Zielanreicherung mit Sonden: Sure Select Human All Exon v6 (Agilent) und xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT).

● Sequenzierung auf Illumina NovaSeq.

● Bioinformatische Pipeline, die auf die Analyse von Krankheiten oder Tumoren ausgerichtet ist.

Servicevorteile

Zielt auf die proteinkodierende Region ab: Durch die Erfassung und Sequenzierung proteinkodierender Regionen wird hWES verwendet, um Varianten im Zusammenhang mit der Proteinstruktur aufzudecken.

Kostengünstig:hWES liefert etwa 85 % der mit menschlichen Krankheiten verbundenen Mutationen aus 1 % des menschlichen Genoms.

Hohe Genauigkeit: Mit der hohen Sequenzierungstiefe erleichtert hWES die Erkennung sowohl häufiger Varianten als auch seltener Varianten mit Häufigkeiten von weniger als 1 %.

Strenge Qualitätskontrolle: Wir implementieren fünf zentrale Kontrollpunkte in allen Phasen, von der Proben- und Bibliotheksvorbereitung bis hin zur Sequenzierung und Bioinformatik. Diese sorgfältige Überwachung gewährleistet die Lieferung gleichbleibend hochwertiger Ergebnisse.

Umfassende bioinformatische Analyse: Unsere Pipeline geht über die Identifizierung von Variationen des Referenzgenoms hinaus, da sie fortschrittliche Analysen umfasst, die speziell auf Forschungsfragen im Zusammenhang mit genetischen Aspekten von Krankheiten oder der Tumoranalyse ausgerichtet sind.

Post-Sales-Support:Unser Engagement geht über den Projektabschluss hinaus und umfasst einen dreimonatigen Kundendienstzeitraum. Während dieser Zeit bieten wir Projektnachverfolgung, Unterstützung bei der Fehlerbehebung und Frage-und-Antwort-Sitzungen an, um alle Fragen zu den Ergebnissen zu beantworten.

Beispielspezifikationen

Exon-Capture-Strategie

Sequenzierungsstrategie

Empfohlene Datenausgabe

Sure Select Human All Exon v6 (Agilent)

oder xGen Exome Hybridization Panel v2 (IDT)

 

Illumina NovaSeq PE150

5–10 GB

Bei Mendelschen Störungen/seltenen Krankheiten: > 50x

Für Tumorproben: ≥ 100x

Beispielanforderungen

Probentyp

 

 Menge(Qubit®)

 

Konzentration 

Volumen

 

 

 Reinheit (NanoDrop™)

 

Genomische DNA

 

≥ 50 ng
≥ 6 ng/μL
≥ 15 μL
 
OD260/280=1,8-2,0
 
Keine Verschlechterung, keine Kontamination

 

Bioinformatik

WES_BI-Arbeitsablauf_Disease-01

Die bioinformatische Analyse von hWES-Erkrankungsproben umfasst:

● Sequenzierungsdaten-QC

● Referenzgenomausrichtung

● Identifizierung von SNPs und InDels

● Funktionale Annotation von SNPs und InDels

WES_BI-Arbeitsablauf_Tumor-01

Die bioinformatische Analyse von Tumorproben umfasst:

● Sequenzierungsdaten-QC

● Referenzgenomausrichtung

● Identifizierung von SNPs, InDels und somatischen Variationen

● Identifizierung von Keimbahnvarianten

● Analyse von Mutationssignaturen

● Identifizierung von Antriebsgenen anhand von Gain-of-Function-Mutationen

● Mutationsanmerkung auf der Ebene der Arzneimittelanfälligkeit

● Heterogenitätsanalyse – Berechnung von Reinheit und Ploidie

Service-Workflow

Musterlieferung

Musterlieferung

Pilotversuch

DNA-Extraktion

Bibliotheksvorbereitung

Bibliotheksbau

Sequenzierung

Sequenzierung

Datenanalyse

Datenanalyse

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Datenlieferung

Kundendienst

Kundendienst


  • Vorherige:
  • Nächste:

  • Daten-QC – Statistik der Exom-Erfassung

     

    wps_doc_22

     

    Variantenidentifikation – InDels

    36 Fotos

    Erweiterte Analyse: Identifizierung und Verteilung schädlicher SNPs/InDels – Circos-Plot

     

    Bild 37

    Tumoranalyse: Identifizierung und Verteilung somatischer Mutationen – Circos-Plot

     

    图片38

     

    Tumoranalyse: klonale Abstammungslinien

     

    图片39

     

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