Evolutionäre Genetik

Evolutionäre genetische Studien zielen darauf ab, den evolutionären Verlauf von Populationen mithilfe von Polymorphismusinformationen in Genomsequenzen zu verstehen. Die BMKCloud Evolutionary Genetics-Pipeline ist für die Analyse von WGS- oder Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF)-Daten aus großen Populationen konzipiert. Nach der Qualitätskontrolle der Rohdaten werden die Lesevorgänge am Referenzgenom ausgerichtet und Varianten aufgerufen. Die Pipeline umfasst phylogenetische Baumkonstruktion, Hauptkomponentenanalyse (PCA), Populationsstrukturanalyse, Verknüpfungsungleichgewicht (LD), selektive Sweep-Analyse und Kandidatengenanalyse.