●Plattformen:Illumina Novaseq 6000 und Novaseq X Plus
●Sequenzierungsmodi:PE150 und PE250
●Qualitätskontrolle von Bibliotheken vor der Sequenzierung
●Sequenzierungsdaten QC und Lieferung:Lieferung von QC -Bericht und Rohdaten im Fastq -Format nach Demultiplexing und Filterung der Q30 -Lesungen
●Vielseitigkeit der Sequenzierungsdienste:Der Kunde kann sich für eine Sequenz nach Lane, Flow Cell oder nach Datenmenge (teilweise Spursequenzierung) entscheiden.
●Umfangreiche Erfahrung auf der Illumina -Sequenzierungsplattform:mit Tausenden von geschlossenen Projekten mit verschiedenen Arten.
●Lieferung des Sequenzierungs -QC -Berichts:mit Qualitätsmetriken, Datengenauigkeit und Gesamtleistung des Sequenzierungsprojekts.
●Reifer Sequenzierungsprozess:mit kurzer Turn-Around-Zeit.
●Strenge Qualitätskontrolle: Wir implementieren strenge QC-Anforderungen, um die Bereitstellung konsequent hochwertiger Ergebnisse zu gewährleisten.
Plattform | Flusszelle | Sequenzierungsmodus | Einheit | Geschätzter Ausgang |
Novaseq x | 10B (8 Spuren) | PE150 | einspurig Teilspur | 375 GB / Spur |
25b (8 Spuren) | PE150 | einspurig Teilspur | 1000 GB/Spur | |
Novaseq 6000 | SP -Flusszelle (2 Fahrspuren) | PE250 | Flusszelle einspurig Teilspur | 325-400 m Reads / Spur |
S4 -Flusszelle (4 Fahrspuren) | PE150 | Flusszelle einspurig Teilspur | ~ 800 GB / Fahrspur |
Datenmenge (x) | Konzentration (qPCR/nm) | Volumen | |
Teilspur -Sequenzierung
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
Spursequenzierung | Pro Spur | ≥ 1,5 nm / Bibliothekspool | ≥ 25 μl / Bibliothekspool |
Zusätzlich zu Konzentration und Gesamtmenge ist auch ein geeignetes Spitzenmuster erforderlich.
HINWEIS: Die Fahrspursequenzierung von Bibliotheken mit niedriger Diversität erfordert Phix Spike-In, um eine robuste Basisanrufe zu gewährleisten.
Wir empfehlen, vorpoolte Bibliotheken als Beispiele einzureichen. Wenn Sie BMKgene benötigen, um Bibliothekspooling durchzuführen
Die Bibliotheksanforderungen für eine teilweise Spursequenzierung.
Der Hauptpeak sollte innerhalb von 300-450 bp liegen.
Bibliotheken sollten einen einzelnen Hauptpeak, keine Adapterkontamination und keine Primer -Dimere haben.
Ein Bericht über die Qualität der Bibliothek wird vor der Abfolge, der Bewertung der Bibliotheksmenge und der Fragmentierung bereitgestellt.
Tabelle 1. Statistik zu Sequenzierungsdaten.
Beispiel -ID | Bmkid | Rohe liest | Rohdaten (BP) | Clean Reads (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870,120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4,415.360.100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Abbildung 1. Qualitätsverteilung entlang der Lesevorgänge in jeder Probe
Abbildung 2. Basisinhaltsverteilung
Abbildung 3.. Verteilung von Leseinhalten in Sequenzierungsdaten