CIRCRNA-Sequenzierung-Illumina
Merkmale
● RRNA-Depletion, gefolgt von der Vorbereitung der Richtungsbibliothek, die Strangspezifische Sequenzierungsdaten ermöglicht.
● Der bioinformatische Workflow ermöglicht eine circRNA -Vorhersage und Expressionsquantifizierung
Servicevorteile
●Umfassendere RNA -Bibliotheken:Wir verwenden eine rRNA-Depletion anstelle einer linearen RNA-Depletion in unserem Prä-Library-Präparat, um sicherzustellen
●Optionale Analyse von CERNA -Netzwerken der wettbewerbsfähigen endogenen RNA (CENNA): Tiefere Einblicke in zelluläre regulatorische Mechanismen geben
●Umfangreiches Fachwissen: Mit einer Erfolgsbilanz bei der Verarbeitung von mehr als 20.000 Proben bei BMKgene, über verschiedene Stichprobentypen und LNCRNA -Projekte bringt unser Team eine Fülle von Erfahrung in jedes Projekt ein.
●Strenge Qualitätskontrolle: Wir implementieren Kernkontrollpunkte in allen Stufen, von der Proben- und Bibliotheksvorbereitung bis hin zur Sequenzierung und Bioinformatik. Diese akribische Überwachung sorgt für die Bereitstellung konsequent hochwertiger Ergebnisse.
● Unterstützung nach dem Verkauf: Unser Engagement geht über den Abschluss des Projekts mit einem 3-monatigen Nachverkaufsdauer hinaus. Während dieser Zeit bieten wir Projekt-Follow-up, Fehlerbehebung und Q & A-Sitzungen an, um alle Abfragen im Zusammenhang mit den Ergebnissen zu beheben.
Probenanforderungen und Lieferung
| Bibliothek | Plattform | Empfohlene Daten | Daten QC |
| rRNA -abgereicherte Richtungsbibliothek | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30 ≥ 85% |
Beispielanforderungen:
Nukleotide:
| Conc. (Ng/μl) | Menge (μg) | Reinheit | Integrität |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Begrenzte oder keine Protein- oder DNA -Kontamination auf Gel. | Rin ≥ 6,0; 5,0 ≥ 28s/18s ≥ 1,0; begrenzte oder keine Grundlinienerhebung |
● Pflanzen:
Wurzel, Stamm oder Blütenblatt: 450 mg
Blatt oder Samen: 300 mg
Frucht: 1,2 g
● Tier:
Herz oder Darm: 450 mg
Eingeweide oder Gehirn: 240 mg
Muskel: 600 mg
Knochen, Haare oder Haut: 1,5 g
● Arthropoden:
Insekten: 9g
Crustacea: 450 mg
● Vollblut:2 Röhrchen
● Zellen: 106 Zellen
● Serum und Plasma: 6 ml
Empfohlene Probenzustellung
Behälter: 2 ml Zentrifugenrohr (Zinnfolie wird nicht empfohlen)
Beispielkennzeichnung: Gruppe+Replikat zB A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Lieferung:
1. Trockeneis: Proben müssen in Beutel gepackt und in Trockeneis begraben werden.
2. RNAsable -Röhrchen: RNA -Proben können in RNA -Stabilisierungsrohr (z. B. RNastable®) getrocknet und bei Raumtemperatur versendet werden.
Service Work Flow
Experimententwurf
Probenabgabe
RNA -Extraktion
Bibliothekskonstruktion
Sequenzierung
Datenanalyse
Nachverkaufsdienste
Bioinformatik
CIRCRNA -Vorhersage: Chromosomenverteilung
Differentiell exprimiertes Circrnas - Volcano -Diagramm
Differentiell ausdrückte circrnas - hierarchische Clusterbildung
Funktionelle Anreicherung von CIRCRNA -Wirtsgenen
Untersuchen Sie die Forschungsergebnisse, die durch die circRNA -Sequenzierungsdienste von Bmkgene durch eine kuratierte Sammlung von Veröffentlichungen erleichtert wurden.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 reguliert die kircRNA -Bildung und die microRNA -vermittelte Gen -Stummschaltung bei hepatozellulärem Karzinom', Oncogen 2021 40:25, 40 (25), S. 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'x oo-responsives Transkriptom zeigt die Rolle des kreisförmigen RNA133 bei der Krankheitsresistenz durch Regulierung der Expression von Osarab in Reis', Phytopathologische Forschung, 5 (1), S. 1–14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/figures/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 moduliert das Gleichgewicht der kreisförmigen und linearen Transkripte im hepatozellulären Karzinom. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'umfassende Bewertung von Circrnas bei Zirrhose -Kardiomyopathie vor und nach der Lebertransplantation', International Immunopharmacology, 114, p. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
