CIRCRNA

Kreisförmige RNAs (CIRCRNAs) sind nicht-kodierende RNAs, die kreisförmige Strukturen bilden und mehrere regulatorische Rollen aufweisen, einschließlich der Konkurrenz mit miRNA für Zielgene und Proteinbindung. Die CircRNA-Pipeline von BMKCloud ist für die Analyse von rRNA-abgereicherten Bibliotheken mit einem gut annotierten und qualitativ hochwertigen Referenzgenom ausgelegt. Die Analyse beginnt mit dem Lesen von Trimm- und Qualitätskontrolle, gefolgt von der Les -Ausrichtung auf das Referenzgenom und die Vorhersage neuer CIRCRNAs sowie die Identifizierung bekannter Circrnas aus Datenbanken. Anschließend werden die entsprechenden miRNA -Ziele und circRNA -Wirte identifiziert. Die differentielle Expressionsanalyse zeigt differentiell exprimierte CIRCRNAs, und die entsprechenden Wirte werden funktional annotiert, um angereicherte biologische Funktionen zu extrahieren.