Bakterien- und Pilz-Gesamtgenom-Resequenzierung
Bakterien- und Pilz-RE-Sequenzierungsprojekte im gesamten Genom sind entscheidend für die Weiterentwicklung der mikrobiellen Genomik, indem sie den Abschluss und den Vergleich von mikrobiellen Genomen ermöglichen. Dies erleichtert die Fermentationstechnik, die Optimierung von industriellen Prozessen und die Erforschung sekundärer Stoffwechselwege. Darüber hinaus ist die Wiedersequenzierung von Pilz- und Bakterien von entscheidender Bedeutung für das Verständnis der Anpassung der Umwelt, die Optimierung von Stämmen und die Aufdeckung der genetischen Evolutionendynamik mit breiten Auswirkungen auf Medizin, Landwirtschaft und Umweltwissenschaft.
Servicevorteile
●Die bioinformatische Analyse enthält Variantenaufruf:Bereitstellung funktioneller Einblicke in die wiedersequenzierten Genome.
● umfangreiches Fachwissen: Mit Tausenden von mikrobiellen Requencing-Projekten, die jährlich durchgeführt werden, bringen wir mehr als ein Jahrzehnt Erfahrung, ein hochqualifiziertes Analyseteam, umfassende Inhalte und exzellente Unterstützung nach dem Verkauf.
●Unterstützung nach dem Verkauf:Unser Engagement geht über den Abschluss des Projekts hinaus mit einer 3-monatigen Nachverkaufsdauer hinaus. Während dieser Zeit bieten wir Projekt-Follow-up, Fehlerbehebung und Q & A-Sitzungen an, um alle Abfragen im Zusammenhang mit den Ergebnissen zu beheben.
Servicespezifikationen
| Sequenzierungsplattform | Sequenzierungsstrategie | Daten empfohlen | Qualitätskontrolle |
| Illumina Novaseq | PE150 | Tiefe von 100x | Q30 ≥ 85% |
Stichprobenanforderungen
| Konzentration (ng/µl) | Gesamtbetrag (NG) | Volumen (ul) |
| ≥1 | ≥ 60 | ≥20 |
Bakterien: ≥1x107 Zellen
Einzelligen Pilze: ≥5x106-1x107 Zellen
Makropilze: ≥4g
Service Work Flow
Probenabgabe
Bibliothekskonstruktion
Sequenzierung
Datenanalyse
Nachverkaufsdienste
Enthält die folgende Analyse:
- Datenqualitätsregelung der Datenqualität
- Ausrichtung auf das Referenzgenom
- Variante Anruf: SNP und Indel
- Variante Annotation
Variante Anruf: SNP -Typen
Variante Anruf: Indeldlängenverteilung
Untersuchen Sie die Fortschritte, die durch die mikrobielle Genom-Resequenzierungsdienste von BMKgene durch eine kuratierte Sammlung von Veröffentlichungen erleichtert werden.
Jia, Y. et al. (2023) 'Kombinieren von Transkriptom und Wiederverssequenzierung des gesamten Genoms, um Krankheitsresistenzgene für Weizenzwerg in Bunt zu untersuchen',Internationales Journal of Molecular Sciences, 24 (24). doi: 10.3390/ijms242417356.
Jiang, M. et al. (2023) 'Ampicillin-kontrollierter Glukosestoffwechsel manipuliert den Übergang von Toleranz zu Resistenz in Bakterien',Wissenschaft Fortschritte, 9 (10). doi: 10.1126/sciadv.ade8582/Suppl_file/sciadv.ade8582_sm.pdf.
Yang, M. et al. (2022) 'Aliidiomarina Halalkaliphila sp. Nov., ein Haloalkaliphilic -Bakterium, das aus einem Soda -See in der autonomen Region der inneren Mongolei isoliert ist, China, int. J. Syst. Evol.Mikrobiol, 72, p. 5263. Doi: 10.1099/ijsem.0.005263.
Zhu, Z., Wu, R. und Wang, G.-H. (2024) 'Genomsequenz von Staphylococcus nepalensis ZZ-2023a, isoliert aus Nasonia vitripennis',Microbiology -Ressourcenankündigungen. doi: 10.1128/mra.00802-23.
