Lille RNA

Små RNA'er er korte ikke-kodende RNA'er med en gennemsnitlig længde på 18-30 nt, inklusive miRNA, siRNA og PIRNA, der spiller vigtige roller i lovgivningsmæssige processer. BMKCloud SRNA -rørledningen giver både standard og brugerdefineret analyse til miRNA -identifikation. Efter læst trimning og kvalitetskontrol er læsninger justeret mod flere databaser for at klassificere SRNA'er og vælge miRNA'er og kortlagt til referencegenomet. miRNA'er identificeres baseret på kendte miRNA -databaser, der giver information om sekundær struktur, miRNA -familie og målgener. Differentialekspressionsanalyse identificerer differentielt udtrykte miRNA'er, og de tilsvarende målgener er funktionelt annoteret for at finde berigede kategorier.