-
BMKMANU S3000_Spatialt transkriptom
Spatial transcriptomics står i spidsen for videnskabelig innovation og giver forskere mulighed for at dykke ned i indviklede genekspressionsmønstre i væv, mens de bevarer deres rumlige kontekst. Blandt forskellige platforme har BMKGene udviklet BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, som kan prale af en forbedret opløsning på 3,5 µm, når det subcellulære område og muliggør opløsningsindstillinger på flere niveauer. S3000-chippen, der har cirka 4 millioner pletter, anvender mikrobrønde lagdelt med perler fyldt med rumligt stregkodede indfangningsprober. Et cDNA-bibliotek, beriget med rumlige stregkoder, fremstilles ud fra S3000-chippen og sekventeres efterfølgende på Illumina NovaSeq-platformen. Kombinationen af rumligt stregkodede prøver og UMI'er sikrer nøjagtigheden og specificiteten af de genererede data. BMKManu S3000-chippen er ekstremt alsidig og tilbyder opløsningsindstillinger på flere niveauer, der kan finjusteres til forskellige væv og ønskede detaljeringsniveauer. Denne tilpasningsevne positionerer chippen som et fremragende valg til forskellige rumlige transkriptomiske undersøgelser, hvilket sikrer præcis rumlig klyngning med minimal støj. Brugen af cellesegmenteringsteknologi med BMKManu S3000 muliggør afgrænsning af transskriptionelle data til cellernes grænser, hvilket resulterer i en analyse, der har direkte biologisk betydning. Desuden resulterer den forbedrede opløsning af S3000 i et højere antal gener og UMI'er detekteret pr. celle, hvilket muliggør en meget mere nøjagtig analyse af de rumlige transkriptionsmønstre og klyngedannelse af celler.
-
DNBSEQ præfabrikerede biblioteker
DNBSEQ, udviklet af MGI, er en innovativ NGS-teknologi, der har formået at reducere sekventeringsomkostningerne yderligere og øge gennemløbet. Fremstilling af DNBSEQ-biblioteker involverer DNA-fragmentering, fremstilling af ssDNA og rullende cirkelamplifikation for at opnå DNA-nanokuglerne (DNB). Disse sættes derefter på en fast overflade og sekventeres efterfølgende ved kombinatorisk probe-ankersyntese (cPAS). DNBSEQ-teknologi kombinerer fordelene ved at have en lav forstærkningsfejlrate med brug af højdensitetsfejlmønstre med nanobolde, hvilket resulterer i sekventering med højere gennemløb og nøjagtighed.
Vores præfabrikerede bibliotekssekventeringsservice gør det muligt for kunder at forberede Illumina-sekventeringsbiblioteker fra forskellige kilder (mRNA, hele genom, amplikon, 10x biblioteker, blandt andre), som konverteres til MGI-biblioteker i vores laboratorier for at blive sekventeret i DNBSEQ-T7, hvilket gør det muligt høje datamængder til lavere omkostninger.
-
Hi-C baseret Chromatin Interaction
Hi-C er en metode designet til at fange genomisk konfiguration ved at kombinere sonderende nærhedsbaserede interaktioner og high-throughput sekventering. Metoden er baseret på kromatintværbinding med formaldehyd, efterfulgt af fordøjelse og re-ligering på en måde, så kun fragmenter, der er kovalent bundet, vil danne ligeringsprodukter. Ved at sekventere disse ligeringsprodukter er det muligt at studere 3D-organiseringen af genomet. Hi-C gør det muligt at studere fordelingen af de dele af genomet, der er let pakket (A-rum, euchromatin) og mere tilbøjelige til at være transkriptionelt aktive, og de regioner, der er mere tætpakket (B-rum, Heterochromatin). Hi-C kan også bruges til at udpege topologisk associerede domæner (TAD'er), regioner af genomet, der har foldede strukturer og sandsynligvis har lignende ekspressionsmønstre, og til at identificere kromatinsløjfer, DNA-områder, der er forankret sammen af proteiner, og som er ofte beriget med regulatoriske elementer. BMKGenes Hi-C-sekventeringstjeneste giver forskere mulighed for at udforske de rumlige dimensioner af genomik, hvilket åbner nye veje til at forstå genomregulering og dens implikationer i sundhed og sygdom.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant RNA Kit
Rens total-RNA af høj kvalitet fra plantevæv
-
TGuide Smart Blood/Cell/Væv RNA Kit
TGuide Smart Blood/Cell/Væv RNA Kit
Det forfyldte patron-/pladereagenssæt til oprensning af høj-udbytte, høj renhed, højkvalitets, inhibitorfri total-RNA fra dyrevæv/celle/frisk fuldblod
-
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
TGuide Smart Magnetic Plant DNA Kit
Rens genomisk DNA af høj kvalitet fra forskellige plantevæv
-
TGuide Smart Soil / Tabured DNA Kit
TGuide Smart Soil / Tabured DNA Kit
Oprenser inhibitorfrit DNA af høj renhed og kvalitet fra jord- og afføringsprøver
-
TGuide Smart DNA-rensningssæt
Genvinder højkvalitets-DNA fra PCR-produkt eller agarosegeler.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Det forfyldte patron/pladereagenssæt til genomisk DNA-oprensning fra blod og buffy coat
-
TGuide Smart Magnetic Tissue DNA Kit
Det forfyldte patron/pladereagenssæt til genomisk DNA-ekstraktion fra dyrevæv
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Det forfyldte patron-/pladereagenssæt til oprensning af genomisk DNA fra blod, tørret blodplet, bakterier, celler, spyt, mundvab, dyrevæv osv.
-
TGuide S16 nukleinsyreekstraktor
TGuide S16 nukleinsyreekstraktor
Brugervenligt bordinstrument, 1-8 eller 16 prøver på samme tid
Katalognummer / emballage
Kat. ingen
ID
Antal forberedelser
OSE-S16-AM
1 sæt
-
PacBio 2+3 mRNA-opløsning i fuld længde
Mens NGS-baseret mRNA-sekventering er et alsidigt værktøj til at kvantificere genekspression, begrænser dens afhængighed af korte læsninger dens effektivitet i komplekse transkriptomiske analyser. På den anden side anvender PacBio-sekventering (Iso-Seq) langlæst teknologi, der muliggør sekventering af fuldlængde mRNA-transkripter. Denne tilgang letter en omfattende udforskning af alternativ splejsning, genfusioner og polyadenylering, selvom det ikke er det primære valg til kvantificering af genekspression. 2+3-kombinationen bygger bro mellem Illumina og PacBio ved at stole på PacBio HiFi-læsninger for at identificere det komplette sæt af transkriptisoformer og NGS-sekventering for at kvantificere de identiske isoformer.
Platforme: PacBio Sequel II/ PacBio Revio og Illumina NovaSeq;
