Transkriptom er forbindelsen mellem genomisk genetisk information og proteomet af biologisk funktion. Regulering af transkriptionelt niveau er den vigtigste og den mest studerede reguleringstilstand for organismer. Transkriptomsekventering kan sekvensere transkriptomet på ethvert tidspunkt eller under enhver betingelse, med en opløsning, der er nøjagtig til et enkelt nukleotid. Det kan dynamisk afspejle niveauet for gentranskription, samtidig identificere og kvantificere sjældne og normale transkripter og give strukturel information om Eksempler på specifikke transkripter.
På nuværende tidspunkt er transkriptom -sekventeringsteknologi blevet vidt brugt i agronomi, medicin og andre forskningsområder, herunder regulering af dyre- og planteudvikling, miljøtilpasning, immuninteraktion, genlokalisering, artsgenetisk udvikling og detektion af tumor og genetisk sygdom.