Evolutionær genetik

Evolutionære genetiske undersøgelser sigter mod at forstå den evolutionære bane for populationer ved hjælp af polymorfismeinformation i genomiske sekvenser. BMKCloud Evolutionary Genetics Pipeline er designet til at analysere WGS eller specifikt-locus-amplificeret fragment (SLAF) data fra store populationer. Efter kvalitetskontrol af de rå data kaldes læsninger til referencegenomet, og varianter kaldes. Rørledningen inkluderer fylogenetisk trækonstruktion, hovedkomponentanalyse (PCA), populationsstrukturanalyse, sammenkobling af sammenkobling af sammenkobling (LD), selektiv fejeanalyse og kandidatgenanalyse.