Exclusive Agency for Korea

条形 Banner-03

Produkter

Illumina foruddannede biblioteker

Illumina -sekventeringsteknologi, baseret på sekventering ved syntese (SBS), er en globalt omfavnet NGS -innovation, der er ansvarlig for at generere over 90% af verdens sekventeringsdata. Princippet om SBS involverer billeddannelse fluorescerende mærket reversible terminatorer, når hver DNTP tilsættes, og derefter spaltes for at muliggøre inkorporering af den næste base. Med alle fire reversible terminatorbundne DNTP'er, der er til stede i hver sekventeringscyklus, minimerer naturlig konkurrence inkorporeringsbias. Denne alsidige teknologi understøtter både enkeltlæsnings- og parret-end-biblioteker, der serverer en række genomiske applikationer. Illumina-sekventeringens kapacitet med høj kapacitet og præcision placerer det som en hjørnesten i genomikforskning, hvilket giver forskere mulighed for at afsløre genomernes vanskeligheder med uovertruffen detaljer og effektivitet.

Vores foruddannede biblioteks sekventeringstjeneste gør det muligt for kunder at forberede sekventeringsbiblioteker fra forskellige kilder (mRNA, hele genom, amplicon, 10x biblioteker, blandt andre). Efterfølgende kan disse biblioteker sendes til vores sekventeringscentre for kvalitetskontrol og sekventering i Illumina -platforme.


Serviceoplysninger

Demo -resultat

Funktioner

Platforme:Illumina Novaseq 6000 og Novaseq X Plus

Sekventeringstilstande:PE150 og PE250

Kvalitetskontrol af biblioteker inden sekventering

Sekventering af data QC og levering:Levering af QC -rapport og rå data i Fastq -format efter demultiplexing og filtrering af Q30 -læsninger

 

 

Servicefordele

Alsidighed af sekventeringstjenester:Kunden kan vælge at sekvensere ved bane, flowcelle eller efter mængden af ​​de krævede data (delvis bane -sekventering).

Omfattende erfaring på Illumina -sekventeringsplatform:med tusinder af lukkede projekter med forskellige arter. 

Levering af sekventering af QC -rapport:med kvalitetsmetrik, datagøjagtighed og den samlede ydelse af sekventeringsprojektet.

Ældre sekventeringsproces:med kort omdrejningstid.

Streng kvalitetskontrol: Vi implementerer strenge QC-krav for at garantere levering af konsekvent resultater af høj kvalitet.

 

 

Eksempelplatforme

Platform

Flowcelle

Sekventeringstilstand

Enhed

Estimeret output

Novaseq x

10b (8 baner)

PE150

Enkelt bane

Delvis bane

375 GB / bane

25b (8 baner)

PE150

Enkelt bane

Delvis bane

1000 GB/bane

Novaseq 6000

SP Flow Cell (2 baner)

PE250

Flowcelle

Enkelt bane

Delvis bane

325-400 m læser / bane

S4 Flow Cell (4 baner)

PE150

Flowcelle

Enkelt bane

Delvis bane

~ 800 GB / bane

Prøvebehov

 

Databeløb (x)

Koncentration (QPCR/NM)

Bind

Delvis bane -sekventering

 

 

X ≤ 10 GB

≥ 1 nm

≥ 25 μl

10 GB <x ≤ 50 GB

≥ 2 nm

≥ 25 μl

50 GB <x ≤ 100 GB

≥ 3 nm

≥ 25 μl

X> 100 GB

≥ 4 nm

≥ 25 μl

Bane sekventering

Pr. Bane

≥ 1,5 nm / bibliotekspulje

≥ 25 μl / bibliotekspool

Foruden koncentration og det samlede beløb kræves også et passende spidsmønster.

Bemærk: Lane-sekventering af biblioteker med lav mangfoldighed kræver Phix Spike-in for at sikre robust basisopkald.

Vi anbefaler at indsende pre-pulserede biblioteker som prøver. Hvis du har brug for Bmkgene for at udføre bibliotekets pooling, kan du henvise til

Bibliotekets krav til delvis bane -sekventering.

Bibliotekstørrelse (Peak Map)

Hovedtopen skal være inden for 300-450 bp.
Biblioteker skal have en enkelt hovedtop, ingen adapterforurening og ingen primerdimere.

Kontakt os, hvis dine prøver ikke opfylder kravene til udgangsmateriale.

Service Workflow

Prøveforberedelse

Bibliotekskvalitetskontrol

Sekventering

Sekventering

Dataanalyse

Datakvalitetskontrol

Prøve QC

Projektlevering


  • Tidligere:
  • Næste:

  • Bibliotek QC -rapport

    En rapport om bibliotekets kvalitet leveres inden sekventering, vurdering af biblioteksbeløb og fragmentering.

     

    Sekventering af QC -rapport

     

    Tabel 1. Statistik om sekventeringsdata.

    Prøve -id

    Bmkid

    Raw læser

    Rå data (BP)

    Clean Reads (%)

    Q20 (%)

    Q30 (%)

    GC (%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96.48

    99.14

    94,85

    36.67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96.00

    98,95

    93,89

    37.08

    Figur 1. Kvalitetsfordeling langs læsninger i hver prøve

    A9

    Figur 2. Basisindholdsfordeling

    A10

    Figur 3. Distribution af læseindhold i sekventeringsdata

    A11

     

    Få et tilbud

    Skriv din besked her og send den til os

    Send din besked til os: