●Platforme:Illumina Novaseq 6000 og Novaseq X Plus
●Sekventeringstilstande:PE150 og PE250
●Kvalitetskontrol af biblioteker inden sekventering
●Sekventering af data QC og levering:Levering af QC -rapport og rå data i Fastq -format efter demultiplexing og filtrering af Q30 -læsninger
●Alsidighed af sekventeringstjenester:Kunden kan vælge at sekvensere ved bane, flowcelle eller efter mængden af de krævede data (delvis bane -sekventering).
●Omfattende erfaring på Illumina -sekventeringsplatform:med tusinder af lukkede projekter med forskellige arter.
●Levering af sekventering af QC -rapport:med kvalitetsmetrik, datagøjagtighed og den samlede ydelse af sekventeringsprojektet.
●Ældre sekventeringsproces:med kort omdrejningstid.
●Streng kvalitetskontrol: Vi implementerer strenge QC-krav for at garantere levering af konsekvent resultater af høj kvalitet.
Platform | Flowcelle | Sekventeringstilstand | Enhed | Estimeret output |
Novaseq x | 10b (8 baner) | PE150 | Enkelt bane Delvis bane | 375 GB / bane |
25b (8 baner) | PE150 | Enkelt bane Delvis bane | 1000 GB/bane | |
Novaseq 6000 | SP Flow Cell (2 baner) | PE250 | Flowcelle Enkelt bane Delvis bane | 325-400 m læser / bane |
S4 Flow Cell (4 baner) | PE150 | Flowcelle Enkelt bane Delvis bane | ~ 800 GB / bane |
Databeløb (x) | Koncentration (QPCR/NM) | Bind | |
Delvis bane -sekventering
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
Bane sekventering | Pr. Bane | ≥ 1,5 nm / bibliotekspulje | ≥ 25 μl / bibliotekspool |
Foruden koncentration og det samlede beløb kræves også et passende spidsmønster.
Bemærk: Lane-sekventering af biblioteker med lav mangfoldighed kræver Phix Spike-in for at sikre robust basisopkald.
Vi anbefaler at indsende pre-pulserede biblioteker som prøver. Hvis du har brug for Bmkgene for at udføre bibliotekets pooling, kan du henvise til
Bibliotekets krav til delvis bane -sekventering.
Hovedtopen skal være inden for 300-450 bp.
Biblioteker skal have en enkelt hovedtop, ingen adapterforurening og ingen primerdimere.
En rapport om bibliotekets kvalitet leveres inden sekventering, vurdering af biblioteksbeløb og fragmentering.
Tabel 1. Statistik om sekventeringsdata.
Prøve -id | Bmkid | Raw læser | Rå data (BP) | Clean Reads (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figur 1. Kvalitetsfordeling langs læsninger i hver prøve
Figur 2. Basisindholdsfordeling
Figur 3. Distribution af læseindhold i sekventeringsdata