Dilyniant Bisul Genom cyfan (WGBs)
Mae dilyniant bisulfite genom cyfan (WGBS) yn sefyll fel y fethodoleg safon aur ar gyfer archwilio methylation DNA yn fanwl, yn benodol y pumed safle mewn cytosin (5-mc), rheolydd canolog mynegiant genynnau a gweithgaredd cellog. Mae'r egwyddor sy'n sail i WGBs yn cynnwys triniaeth bisulfite, gan ysgogi trosi cytosinau heb eu hidlo yn uracil (c i u), wrth adael cytosinau methylated yn ddigyfnewid. Mae'r dechneg hon yn cynnig datrysiad un sylfaen, gan ganiatáu i ymchwilwyr ymchwilio'n gynhwysfawr i'r methylome a datgelu patrymau methylation annormal sy'n gysylltiedig â chyflyrau amrywiol, yn enwedig canser. Trwy gyflogi WGBs, gall gwyddonwyr gael mewnwelediadau digymar i dirweddau methylation genom-gyfan, gan ddarparu dealltwriaeth arlliw o'r mecanweithiau epigenetig sy'n sail i brosesau a chlefydau biolegol amrywiol.
Nodweddion gwasanaeth
● Angen genom cyfeirio.
● Ychwanegir DNA Lambda i fonitro effeithlonrwydd trosi bisulfite.
● Dilyniant ar Illumina Novaseq.
Manteision gwasanaeth
●Safon aur ar gyfer ymchwil methylation DNA: Mae gan y dechnoleg prosesu trosi methylation aeddfed gywirdeb uchel ac atgynyrchioldeb da.
●Sylw eang a datrysiad un sylfaen:Canfod safleoedd methylation ar y lefel genom-gyfan.
●Platfform cyflawn:Darparu gwasanaeth rhagorol un stop o brosesu sampl, adeiladu llyfrgelloedd, dilyniannu i ddadansoddiad biowybodeg.
●Arbenigedd helaeth: Gyda phrosiectau dilyniannu WGBS wedi'u cwblhau'n llwyddiannus ar draws ystod amrywiol o rywogaethau, mae BMKGENE yn dod â dros ddegawd o brofiad, tîm dadansoddi medrus iawn, cynnwys cynhwysfawr, a chefnogaeth ragorol ar ôl gwerthu.
●Posibilrwydd i ymuno â dadansoddiad trawsgrifiadomeg: gan ganiatáu ar gyfer dadansoddiad integredig o WGBs gyda data OMICS eraill fel RNA-seq.
Manylebau sampl
| Lyfrgell | Strategaeth Dilyniannu | Allbwn data a argymhellir | Rheoli Ansawdd |
| Bisulfite wedi'i drin | Illumina PE150 | Dyfnder 30x | Q30 ≥ 85% Trosi Bisulfite> 99% |
Gofynion Sampl
| Crynodiad | Cyfanswm (µg) | Gofynion ychwanegol | |
| DNA Genomig | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Diraddio neu halogi cyfyngedig |
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dosbarthu Sampl
Echdynnu DNA
Adeiladu Llyfrgell
Dilyniant
Dadansoddiad Data
Cyflwyno Data
Yn cynnwys y dadansoddiad canlynol:
● Rheoli ansawdd dilyniant amrwd;
● Mapio i Genom Cyfeirio;
● Canfod seiliau methylated 5mc;
● Dadansoddiad o ddosbarthiad ac anodi methylation;
● Dadansoddiad o ranbarthau methylated gwahanol (DMRs);
● Anodi swyddogaethol genynnau sy'n gysylltiedig â DMRs.
Canfod methylation 5mc: mathau o safleoedd methylated
Map Methylation. Dosbarthiad genom methylation 5mc ar draws
Anodi rhanbarthau methylated iawn
Rhanbarthau methylated gwahanol: genynnau cysylltiedig
Rhanbarthau methylated gwahanol: anodi genynnau cysylltiedig (ontoleg genynnau)
Archwiliwch y datblygiadau ymchwil a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu bisulfite genom cyfan BMKGENE trwy gasgliad wedi'i guradu o gyhoeddiadau.
Fan, Y. et al. (2020) 'Dadansoddiad o broffiliau methylation DNA yn ystod datblygiad cyhyrau ysgerbydol defaid gan ddefnyddio dilyniant bisulfite genom cyfan',Genomeg BMC, 21 (1), tt. 1–15. doi: 10.1186/a12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) 'aflonyddwch methylation asid deoxyribonucleig nofel mewn gweithwyr sy'n agored i finyl clorid',Gwenwyneg ac iechyd diwydiannol, 38 (7), tt. 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) 'Perthynas rhwng methylation genom, lefelau RNAs nad ydynt yn codio, mRNAs a metabolion wrth aeddfedu ffrwythau tomato',Y Cyfnodolyn Planhigion, 103 (3), tt. 980–994. doi: 10.1111/tpj.14778.
