Dilyniannu RNA Bach-Illumina
Nodweddion
● Mae paratoi'r llyfrgell yn cynnwys cam dewis maint
● Roedd dadansoddiad biowybodus yn canolbwyntio ar ragfynegiad miRNA a'u targedau
Manteision Gwasanaeth
●Dadansoddiad biowybodeg cynhwysfawr:Galluogi adnabod miRNAs hysbys a newydd, nodi targedau miRNAs, ac anodi swyddogaethol cyfatebol a chyfoethogi gyda chronfeydd data lluosog (KEGG, GO)
●Rheoli Ansawdd Trwyadl: Rydym yn gweithredu pwyntiau rheoli craidd ar draws pob cam, o baratoi sampl a llyfrgell i ddilyniannu a biowybodeg. Mae'r monitro manwl hwn yn sicrhau y cyflwynir canlyniadau o ansawdd uchel yn gyson.
●Cefnogaeth Ôl-werthu: Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau'r prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis. Yn ystod y cyfnod hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.
●Arbenigedd helaeth: Gyda hanes o lwyddo i gau dros brosiectau sRNA lluosog sy'n cwmpasu dros 300 o rywogaethau mewn gwahanol feysydd ymchwil, mae ein tîm yn dod â chyfoeth o brofiad i bob prosiect.
Gofynion Sampl a Chyflenwi
| Llyfrgell | Llwyfan | Data a argymhellir | Data QC |
| Maint wedi'i ddewis | Illumina SE50 | 10M-20M yn darllen | C30≥85% |
Gofynion Sampl:
Niwcleotidau:
| Conc.(ng/μl) | Swm (μg) | Purdeb | Uniondeb |
| ≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Cyfyngedig neu ddim halogiad protein neu DNA a ddangosir ar gel. | RIN≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; drychiad gwaelodlin cyfyngedig neu ddim drychiad gwaelodlin |
● Planhigion:
Gwraidd, Coesyn neu Petal: 450 mg
Deilen neu Had: 300 mg
Ffrwythau: 1.2 g
● Anifail:
Calon neu Berfedd: 450 mg
Viscera neu Ymennydd: 240 mg
Cyhyr: 600 mg
Esgyrn, Gwallt neu Groen: 1.5g
● Arthropodau:
pryfed: 9g
Cramenogion: 450 mg
● Gwaed cyfan: 2 diwb
● Celloedd: 106 celloedd
● Serwm a Plasma:6 mL
Cyflwyno Sampl a Argymhellir
Cynhwysydd: tiwb centrifuge 2 ml (Ni argymhellir ffoil tun)
Labelu enghreifftiol: Grŵp+ at ei gilydd ee A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Cludo:
1. Iâ sych: Mae angen pacio samplau mewn bagiau a'u claddu mewn rhew sych.
2. Tiwbiau RNAstable: Gellir sychu samplau RNA mewn tiwb sefydlogi RNA (ee RNAstable®) a'u cludo yn nhymheredd yr ystafell.
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dyluniad arbrawf
Cyflwyno sampl
echdynnu RNA
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Biowybodeg
● Rheoli ansawdd data crai
● dosbarthiad sRNA
● Aliniad i genom cyfeirio
● Nodi miRNA hysbys a newydd
● Dadansoddiad mynegiant miRNA gwahaniaethol
● Anodi swyddogaethol o dargedau miRNA
Adnabod miRNA: strwythur a dyfnder
Mynegiant gwahaniaethol o miRNA – clystyru hiarchaidd
Anodi swyddogaethol o darged miRNAs wedi'u mynegi'n wahaniaethol
Archwiliwch y datblygiadau ymchwil a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu sRNA BMKGene trwy gasgliad o gyhoeddiadau wedi'u curadu.
Chen, H. et al. (2023) 'Mae heintiau firaol yn atal biosynthesis saponin a ffotosynthesis yn Panax notoginseng', Ffisioleg Planhigion a Biocemeg, 203, t. 108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Mae'r planhigyn FYVE parth-cynnwys protein FREE1 cyswllt gyda chydrannau microbrosesydd i atal biogenesis miRNA', adroddiadau EMBO, 24(1). doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al. (2023) 'Mae MicroRNA Ame-Bantam-3p yn Rheoli Datblygiad Disgyblion Larfal trwy Dargedu'r Parthau Twf Epidermaidd Lluosog tebyg i Ffactorau Twf 8 Gene (megf8) yn y Wenynen Fêl, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), t . 5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Dadansoddiad Integredig o MiRNA a Genynnau sy'n Gysylltiedig ag Ansawdd Cig yn Datgelu bod Gga-MiR-140-5p yn Effeithio ar Ddyddodiad Braster Mewngyhyrol mewn Ieir', Ffisioleg Cellog a Biocemeg, 46(6), tt. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
