-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Mae trawsgrifomeg ofodol ar flaen y gad o ran arloesi gwyddonol, gan rymuso ymchwilwyr i ymchwilio i batrymau mynegiant genynnau cymhleth o fewn meinweoedd wrth gadw eu cyd-destun gofodol. Ynghanol llwyfannau amrywiol, mae BMKGene wedi datblygu'r BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip, gyda datrysiad gwell o 3.5µm, gan gyrraedd yr ystod isgellog, a galluogi gosodiadau datrysiad aml-lefel. Mae'r sglodyn S3000, sy'n cynnwys tua 4 miliwn o smotiau, yn defnyddio microffynnonau wedi'u haenu â gleiniau wedi'u llwytho â stilwyr dal cod-bar gofodol. Mae llyfrgell cDNA, wedi'i chyfoethogi â chodau bar gofodol, yn cael ei pharatoi o'r sglodyn S3000 a'i dilyniannu wedyn ar lwyfan Illumina NovaSeq. Mae'r cyfuniad o samplau â chod bar gofodol ac UMI yn sicrhau cywirdeb a phenodoldeb y data a gynhyrchir. Mae sglodion BMKManu S3000 yn hynod amlbwrpas, gan gynnig gosodiadau datrysiad aml-lefel y gellir eu tiwnio'n fân i wahanol feinweoedd a'r lefelau manylder a ddymunir. Mae'r hyblygrwydd hwn yn gosod y sglodyn fel dewis rhagorol ar gyfer astudiaethau trawsgrifomeg ofodol amrywiol, gan sicrhau clystyru gofodol manwl gywir heb fawr o sŵn. Mae'r defnydd o dechnoleg segmentu celloedd gyda BMKManu S3000 yn galluogi amffinio data trawsgrifio i ffiniau celloedd, gan arwain at ddadansoddiad sydd ag ystyr biolegol uniongyrchol. At hynny, mae cydraniad gwell o S3000 yn arwain at nifer uwch o enynnau ac UMIs a ganfyddir fesul cell, gan alluogi dadansoddiad llawer mwy cywir o'r patrymau trawsgrifio gofodol a chlystyru celloedd.
-
Dilyniannu RNA cnewyllyn sengl
Mae datblygu technegau dal un gell a thechnegau adeiladu llyfrgell wedi'u teilwra, ynghyd â dilyniannu trwybwn uchel, wedi chwyldroi astudiaethau mynegiant genynnau ar lefel celloedd. Mae'r datblygiad arloesol hwn yn caniatáu dadansoddiad dyfnach a mwy cynhwysfawr o boblogaethau celloedd cymhleth, gan oresgyn y cyfyngiadau sy'n gysylltiedig â mynegiant genynnau ar gyfartaledd dros bob cell a chadw'r heterogeneity gwirioneddol o fewn y poblogaethau hyn. Er bod manteision diymwad i ddilyniannu RNA un gell (scRNA-seq), mae'n wynebu heriau mewn meinweoedd penodol lle mae creu ataliad un-gell yn anodd ac yn gofyn am samplau ffres. Yn BMKGene, rydyn ni'n mynd i'r afael â'r rhwystr hwn trwy gynnig dilyniant RNA un cnewyllyn (snRNA-seq) gan ddefnyddio'r dechnoleg Cromiwm Genomeg 10X o'r radd flaenaf. Mae'r dull hwn yn ehangu'r sbectrwm o samplau sy'n addas ar gyfer dadansoddiad trawsgrifio ar lefel un cell.
Mae ynysu cnewyllyn yn cael ei gyflawni trwy'r sglodyn Genomeg Chromium arloesol 10X, sy'n cynnwys system microhylifau wyth sianel gyda chroesfannau dwbl. O fewn y system hon, mae gleiniau gel sy'n ymgorffori codau bar, paent preimio, ensymau, ac un cnewyllyn yn cael eu crynhoi mewn diferion olew maint nanoliter, gan ffurfio Glain Glain-mewn-Emwlsiwn (GEM). Yn dilyn ffurfio GEM, mae lysis celloedd a rhyddhau cod bar yn digwydd o fewn pob GEM. O ganlyniad, mae moleciwlau mRNA yn cael eu trawsgrifio o chwith i cDNAs, gan ymgorffori codau bar 10X a Dynodwyr Moleciwlaidd Unigryw (UMIs). Mae'r cDNAs hyn wedyn yn destun gwaith adeiladu llyfrgell dilyniannu safonol, gan hwyluso archwiliad cadarn a chynhwysfawr o broffiliau mynegiant genynnau ar lefel un gell.
Llwyfan: 10 × Genomeg Cromiwm ac Illumina NovaSeq Llwyfan
-
Trawsgrifiad Gofodol Visium Genomeg 10x
Mae transcriptomeg ofodol yn dechnoleg flaengar sy'n caniatáu i ymchwilwyr ymchwilio i batrymau mynegiant genynnau o fewn meinweoedd wrth gadw eu cyd-destun gofodol. Un platfform pwerus yn y parth hwn yw Genomeg Visium 10x ynghyd â dilyniannu Illumina. Mae egwyddor 10X Visium yn gorwedd ar sglodyn arbenigol gydag ardal ddal ddynodedig lle gosodir adrannau meinwe. Mae'r ardal ddal hon yn cynnwys smotiau cod bar, pob un yn cyfateb i leoliad gofodol unigryw o fewn y meinwe. Yna caiff y moleciwlau RNA a ddaliwyd o'r meinwe eu labelu â dynodwyr moleciwlaidd unigryw (UMIs) yn ystod y broses drawsgrifio o'r chwith. Mae'r smotiau cod bar hyn a'r UMIs yn galluogi mapio gofodol manwl gywir a meintioli mynegiant genynnau ar gydraniad un gell. Mae'r cyfuniad o samplau â chod bar gofodol ac UMI yn sicrhau cywirdeb a phenodoldeb y data a gynhyrchir. Trwy ddefnyddio'r dechnoleg Trawsgrifiad Gofodol hon, gall ymchwilwyr gael dealltwriaeth ddyfnach o drefniadaeth ofodol celloedd a'r rhyngweithiadau moleciwlaidd cymhleth sy'n digwydd o fewn meinweoedd, gan gynnig mewnwelediad amhrisiadwy i'r mecanweithiau sy'n sail i brosesau biolegol mewn meysydd lluosog, gan gynnwys oncoleg, niwrowyddoniaeth, bioleg ddatblygiadol, imiwnoleg. , ac astudiaethau botanegol.
Llwyfan: 10X Genomeg Visium ac Illumina NovaSeq
