-
Dilyniannu Metagenomig -NGS
Mae metagenom yn gasgliad o gyfanswm deunydd genetig cymuned gymysg o organebau, megis metagenomau amgylcheddol a dynol. Mae'n cynnwys genomau micro-organebau y gellir eu trin a rhai na ellir eu trin. Mae dilyniannu metagenomig dryll gyda NGS yn galluogi astudiaeth o'r tirweddau genomig cymhleth hyn sydd wedi'u hymgorffori mewn samplau amgylcheddol trwy ddarparu mwy na phroffilio tacsonomaidd, gan roi mewnwelediadau gronynnog hefyd i amrywiaeth rhywogaethau, deinameg helaethrwydd, a strwythurau poblogaeth cymhleth. Y tu hwnt i astudiaethau tacsonomig, mae metagenomeg dryll hefyd yn cynnig persbectif genomeg swyddogaethol, gan alluogi archwilio genynnau wedi'u hamgodio a'u rolau tybiedig mewn prosesau ecolegol. Yn olaf, mae sefydlu rhwydweithiau cydberthynas rhwng elfennau genetig a ffactorau amgylcheddol yn cyfrannu at ddealltwriaeth gyfannol o'r cydadwaith cymhleth rhwng cymunedau microbaidd a'u cefndir ecolegol. I gloi, mae dilyniannu metagenomig yn offeryn canolog ar gyfer datrys cymhlethdodau genomig cymunedau microbaidd amrywiol, gan amlygu'r perthnasoedd amlochrog rhwng geneteg ac ecoleg o fewn yr ecosystemau cymhleth hyn.
Llwyfannau: Illumina NovaSeq a DNBSEQ-T7
-
Dilyniannu Metagenomig-TGS
Mae metagenom yn gasgliad o ddeunydd genetig cymuned gymysg o organebau, megis metagenomau amgylcheddol a dynol. Mae'n cynnwys genomau micro-organebau y gellir eu trin a rhai na ellir eu trin. Mae dilyniannu metagenomig yn galluogi astudio'r tirweddau genomig cymhleth hyn sydd wedi'u hymgorffori mewn samplau ecolegol trwy ddarparu mwy na phroffilio tacsonomaidd. Mae hefyd yn cynnig persbectif genomeg swyddogaethol trwy archwilio'r genynnau wedi'u hamgodio a'u rolau tybiedig mewn prosesau amgylcheddol. Er bod dulliau gwn saethu traddodiadol gyda dilyniannu Illumina wedi'u defnyddio'n helaeth mewn astudiaethau metagenomig, mae dyfodiad dilyniannu darllen hir Nanopore a PacBio wedi newid y maes. Mae technoleg Nanopore a PacBio yn gwella dadansoddiadau bio-wybodus i lawr yr afon, yn enwedig cydosod metagenom, gan sicrhau mwy o gynulliadau parhaus. Mae adroddiadau'n nodi bod metagenomeg seiliedig ar Nanopore a PacBio wedi llwyddo i gynhyrchu genomau bacteriol cyflawn a chaeedig o ficrobiomau cymhleth (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). Mae integreiddio darlleniadau Nanopore â darlleniadau Illumina yn darparu dull strategol ar gyfer cywiro gwallau, gan liniaru cywirdeb isel cynhenid Nanopore. Mae'r cyfuniad synergaidd hwn yn trosoli cryfderau pob platfform dilyniannu, gan gynnig datrysiad cadarn i oresgyn cyfyngiadau posibl a hyrwyddo cywirdeb a dibynadwyedd dadansoddiadau metagenomig.
Llwyfan: Nanopore PromethION 48, Illumia a PacBio Revio
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Mae genynnau rRNA 16S a 18S, ynghyd â'r rhanbarth Gwahanydd Trawsgrifiedig Mewnol (ITS), yn farcwyr olion bysedd moleciwlaidd canolog oherwydd eu cyfuniad o ranbarthau tra cadwraethol a gor-amrywiol, gan eu gwneud yn offer amhrisiadwy ar gyfer nodweddu organebau procaryotig ac ewcaryotig. Mae ymhelaethu a dilyniannu’r rhanbarthau hyn yn cynnig dull di-ynysu ar gyfer ymchwilio i gyfansoddiad microbau ac amrywiaeth ar draws amrywiol ecosystemau. Er bod dilyniannu Illumina fel arfer yn targedu rhanbarthau gornewidiol byr fel V3-V4 o 16S ac ITS1, dangoswyd bod modd cyflawni anodi tacsonomig uwchraddol trwy ddilyniannu hyd llawn 16S, 18S, ac ITS. Mae'r dull cynhwysfawr hwn yn arwain at ganrannau uwch o ddilyniannau wedi'u dosbarthu'n gywir, gan gyflawni lefel o gydraniad sy'n ymestyn i adnabod rhywogaethau. Mae platfform dilyniannu Amser Real Moleciwl Sengl PacBio (SMRT) yn sefyll allan trwy ddarparu darlleniadau hir hynod gywir (HiFi) sy'n gorchuddio'r amplicons hyd llawn, gan gystadlu â thrachywiredd dilyniannu Illumina. Mae'r gallu hwn yn galluogi ymchwilwyr i ennill mantais heb ei hail - golygfa banoramig o'r dirwedd enetig. Mae'r sylw estynedig yn dyrchafu'n sylweddol y cydraniad mewn anodi rhywogaethau, yn enwedig o fewn cymunedau bacteriol neu ffwngaidd, gan alluogi dealltwriaeth ddyfnach o gymhlethdodau poblogaethau microbaidd.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Mae dilyniannu amplicon gyda thechnoleg Illumina, gan dargedu'n benodol y marcwyr genetig 16S, 18S, ac ITS, yn ddull pwerus ar gyfer datrys y ffylogene, tacsonomeg, a helaethrwydd rhywogaethau o fewn cymunedau microbaidd. Mae'r dull hwn yn cynnwys dilyniannu'r rhanbarthau gor-amrywiol o farcwyr genetig cadw tŷ. Cyflwynwyd yn wreiddiol fel olion bysedd moleciwlaidd ganWoeses et alym 1977, mae'r dechneg hon wedi chwyldroi proffilio microbiomau trwy alluogi dadansoddiadau di-ynysu. Trwy ddilyniannu 16S (bacteria), 18S (ffyngau), a Gwahanydd Trawsgrifiedig Mewnol (ITS, ffyngau), gall ymchwilwyr adnabod nid yn unig rywogaethau toreithiog ond hefyd rai prin ac anhysbys. Wedi'i fabwysiadu'n eang fel offeryn canolog, mae dilyniannu aplicon wedi dod yn allweddol wrth ganfod cyfansoddiadau microbaidd gwahaniaethol ar draws amgylcheddau amrywiol, gan gynnwys y geg ddynol, y coluddion, y stôl, a thu hwnt.
-
Ail-ddilyniannu Genom Cyfan Bacteraidd a Ffwngaidd
Mae prosiectau ail-ddilyniannu genomau cyfan bacteriol a ffwngaidd yn hollbwysig ar gyfer hyrwyddo genomeg microbaidd trwy alluogi genomau microbaidd i gael eu cwblhau a'u cymharu. Mae hyn yn hwyluso peirianneg eplesu, optimeiddio prosesau diwydiannol, ac archwilio llwybrau metaboledd eilaidd. Ar ben hynny, mae ail-ddilyniant ffwngaidd a bacteriol yn hanfodol ar gyfer deall addasu amgylcheddol, optimeiddio straen, a datgelu deinameg esblygiad genetig, gyda goblygiadau eang mewn meddygaeth, amaethyddiaeth a gwyddor amgylcheddol.
-
Dilyniannu RNA procaryotig
Mae dilyniannu RNA yn grymuso proffilio cynhwysfawr yr holl drawsgrifiadau RNA o fewn celloedd o dan amodau penodol. Mae'r dechnoleg flaengar hon yn arf pwerus, gan ddadorchuddio proffiliau mynegiant genynnau cymhleth, strwythurau genynnau, a mecanweithiau moleciwlaidd sy'n gysylltiedig â phrosesau biolegol amrywiol. Wedi'i fabwysiadu'n eang mewn ymchwil sylfaenol, diagnosteg glinigol, a datblygu cyffuriau, mae dilyniannu RNA yn cynnig mewnwelediad i gymhlethdodau dynameg cellog a rheoleiddio genetig. Mae ein prosesu sampl RNA procaryotig wedi'i deilwra ar gyfer trawsgrifiadau procaryotig, sy'n cynnwys disbyddu rRNA a pharatoi llyfrgell cyfeiriadol.
Llwyfan: Illumina NovaSeq
-
Dilyniannu Metatranscriptome
Gan ddefnyddio technoleg dilyniannu Illumina, mae gwasanaeth dilyniannu meta-drawsgriptome BMKGENE yn datgelu mynegiant genynnau deinamig amrywiaeth amrywiol o ficrobau, sy'n rhychwantu ewcaryotau i brocaryotau a firysau, o fewn amgylcheddau naturiol fel pridd, dŵr, môr, stôl, a'r perfedd. Mae ein gwasanaeth cynhwysfawr yn grymuso ymchwilwyr i ymchwilio i broffiliau mynegiant genynnau cyflawn cymunedau microbaidd cymhleth. Y tu hwnt i ddadansoddi tacsonomig, mae ein gwasanaeth dilyniannu metatranscriptome yn hwyluso archwilio i gyfoethogi swyddogaethol, gan daflu goleuni ar enynnau a fynegir yn wahaniaethol a'u rolau. Darganfyddwch gyfoeth o fewnwelediadau biolegol wrth i chi lywio tirweddau cymhleth mynegiant genynnau, amrywiaeth tacsonomig, a dynameg swyddogaethol o fewn y cilfachau amgylcheddol amrywiol hyn.
-
De novo Cynulliad Genom Ffwngaidd
Mae BMKGENE yn cynnig atebion amlbwrpas ar gyfer genomau ffwngaidd, gan ddarparu ar gyfer anghenion ymchwil amrywiol a chyflawnrwydd genom dymunol. Mae defnyddio dilyniannu Illumina darllen byr yn unig yn caniatáu cynhyrchu genom drafft. Mae dilyniannau darllen byr a darllen hir gan ddefnyddio Nanopore neu Pacbio yn cael eu cyfuno ar gyfer genom ffwngaidd mwy coeth gyda contigau hirach. At hynny, mae integreiddio dilyniannu Hi-C yn gwella'r galluoedd ymhellach, gan alluogi cyflawni genom lefel cromosom cyflawn.
-
De novo Cynulliad Genom Bacteraidd
Rydym yn darparu gwasanaeth cydosod genom bacteriol cyflawn, gan warantu 0 bwlch. Mae hyn yn bosibl trwy integreiddio technolegau dilyniannu darllen hir, megis Nanopore a PacBio ar gyfer cydosod a dilyniannu darllen byr ag Illumina ar gyfer dilysu cynulliad a chywiro gwallau darlleniadau ONT. Mae ein gwasanaeth yn darparu'r llif gwaith biowybodeg cyflawn o gydosod, anodi swyddogaethol, a dadansoddiad biowybodeg uwch, gan gyflawni nodau ymchwil penodol. Mae'r gwasanaeth hwn yn galluogi datblygu genomau cyfeirio manwl gywir ar gyfer astudiaethau genetig a genomig amrywiol. Yn ogystal, mae'n sail ar gyfer cymwysiadau fel optimeiddio straen, peirianneg enetig, a datblygu technoleg ficrobaidd, gan sicrhau data genomig dibynadwy a di-fwlch sy'n hanfodol ar gyfer hyrwyddo mewnwelediadau gwyddonol ac arloesi biotechnolegol.
