Genom

Cynulliad ar raddfa cromosom a dadansoddiad o genom miscanthus lutarioriparius cnwd biomas
Dilyniant Nanopore | Illumina | Hi-c | RNA-dilyniant | Ffylogeni
Yn yr astudiaeth hon, darparodd technolegau biomarcwyr gefnogaeth dechnegol ar ddilyniant nanopore, cynulliad genom de novo, cynulliad â chymorth HI-C, ac ati.
Crynodebon
Miscanthus, mae gan blanhigyn lluosflwydd rhisomaidd, botensial mawr ar gyfer cynhyrchu bio -ynni ar gyfer ei fiomas uchel a'i oddefgarwch straen. Rydym yn riportio cynulliad ar raddfa cromosom oMiscanthus lutarioripariusGenom trwy gyfuno dilyniant nanopore Rhydychen a thechnolegau Hi-C. Mae'r cynulliad 2.07-GB yn cynnwys 96.64% o'r genom, gyda contig N50 o 1.71 MB. Mae'r dilyniannau centromere a telomere wedi'u hymgynnull ar gyfer pob un o'r 19 cromosom a chromosom 10, yn y drefn honno. Mae tarddiad allotetraploid yr M. lutarioriparius yn cael ei dderbyn gan ddefnyddio ailadroddiadau lloeren centromerig. Dangosir yn glir strwythur y genom tetraploid a sawl aildrefnu cromosomaidd mewn perthynas â sorghum. Genynnau dyblyg tandem oM. lutarioripariusyn cael eu cyfoethogi swyddogaethol nid yn unig mewn termau sy'n gysylltiedig ag ymateb i straen, ond biosynthesis wal gell. Mae teuluoedd genynnau sy'n gysylltiedig ag ymwrthedd afiechydon, biosynthesis wal gell a chludiant ïon metel yn cael eu hehangu a'u esblygu'n fawr. Gall ehangu'r teuluoedd hyn fod yn sail genomig bwysig ar gyfer gwella nodweddion rhyfeddol oM. Lutarioriparius.
Ystadegau allweddol o gynulliad genom


Ffigur. Trosolwg o Gynulliad Genom M. Lutarioriparius
Newyddion ac Uchafbwyntiau Nod rhannu'r achosion llwyddiannus diweddaraf gyda thechnolegau biomarcwyr, gan ddal cyflawniadau gwyddonol newydd yn ogystal â thechnegau amlwg a gymhwyswyd yn ystod yr astudiaeth.
Amser Post: Ion-05-2022