Metagenomeg (ngs)

Mae metagenomeg gwn gyda Illumina yn offeryn poblogaidd ar gyfer astudio microbiomau trwy ddilyniannu DNA yn uniongyrchol o samplau cymhleth, gan alluogi astudio amrywiaeth tacsonomig a swyddogaethol. Mae'r biblinell Metagenomig BMKCloud (NGS) yn dechrau gyda rheoli ansawdd a chynulliad metagenome, y mae genynnau'n cael eu rhagweld a'u clystyru i setiau data nad ydynt yn rhai disylwedd sydd wedi'u hanodi ar gyfer swyddogaeth a thacsonomeg gan ddefnyddio cronfeydd data lluosog. Defnyddir y wybodaeth hon i ddadansoddi amrywiaeth tacsonomig o fewn sampl (amrywiaeth alffa) ac amrywiaeth rhwng sampl (amrywiaeth beta). Mae dadansoddiad gwahaniaethol rhwng grwpiau yn canfod swyddogaethau OTUs a biolegol sy'n wahanol rhwng y ddau grŵp gan ddefnyddio profion parametrig ac an-barametrig, tra bod dadansoddiad cydberthynas yn cysylltu'r gwahaniaethau hyn â ffactorau amgylcheddol.