Exclusive Agency for Korea

BMKCloud Mewngofnodi

Cynhyrchion

Rhyngweithio Chromatin seiliedig ar Hi-C

Mae Hi-C yn ddull sydd wedi'i gynllunio i ddal cyfluniad genomig trwy gyfuno rhyngweithiadau treiddgar yn seiliedig ar agosrwydd a dilyniannu trwybwn uchel. Mae'r dull yn seiliedig ar groesgysylltu cromatin â fformaldehyd, ac yna treuliad ac ail-ligation mewn ffordd mai dim ond darnau sydd wedi'u cysylltu'n cofalent fydd yn ffurfio cynhyrchion ligiad. Trwy ddilyniannu'r cynhyrchion ligation hyn, mae'n bosibl astudio trefniadaeth 3D y genom. Mae Hi-C yn galluogi astudio dosbarthiad y dognau o'r genom sydd wedi'u pacio'n ysgafn (adran A, euchromatin) ac yn fwy tebygol o fod yn weithgar yn drawsgrifiadol, a'r rhanbarthau sydd wedi'u pacio'n dynnach (adran B, Heterochromatin). Gellir defnyddio Hi-C hefyd i nodi Parthau sy'n Gysylltiedig â Topolegol (TADs), rhanbarthau o'r genom sydd â strwythurau plygu ac sy'n debygol o fod â phatrymau mynegiant tebyg, ac i nodi dolenni cromatin, rhanbarthau DNA sydd wedi'u hangori gyda'i gilydd gan broteinau. yn aml wedi'i gyfoethogi mewn elfennau rheoleiddiol. Mae gwasanaeth dilyniannu Hi-C BMKGene yn grymuso ymchwilwyr i archwilio dimensiynau gofodol genomeg, gan agor llwybrau newydd ar gyfer deall rheoleiddio genomau a'i oblygiadau mewn iechyd a chlefydau.

Cysylltwch â Ni

Manylion Gwasanaeth

Biowybodeg

Canlyniadau demo

Cyhoeddiadau dan sylw

Nodweddion Gwasanaeth

● Dilyniannu ar Illumina NovaSeq gyda PE150.

● Mae angen samplau meinwe, yn lle asidau niwclëig wedi'u tynnu, i groesgysylltu â fformaldehyd a chadw'r rhyngweithiadau DNA-protein.

● Mae'r arbrawf Hi-C yn cynnwys cyfyngu a thrwsio pennau gludiog gyda biotin, ac yna cylchredeg y pennau di-fin sy'n deillio o hynny tra'n cadw'r rhyngweithiadau. Yna caiff y DNA ei dynnu i lawr gyda gleiniau streptavidin a'i buro ar gyfer paratoi'r llyfrgell wedyn.

Manteision Gwasanaeth

●Dyluniad Ensym Cyfyngiad Gorau: i sicrhau effeithlonrwydd Hi-C uchel ar wahanol rywogaethau gyda hyd at 93% o barau rhyngweithio dilys.

●Arbenigedd helaeth a Chofnodion Cyhoeddi:Mae gan BMKGene brofiad helaeth gyda> 2000 o brosiectau dilyniannu Hi-C o 800 o wahanol rywogaethau ac amrywiol batentau. Dros 100 o achosion cyhoeddedig gyda ffactor effaith gronnol o dros 900.

●Tîm Biowybodeg tra medrus:gyda patentau mewnol a hawlfreintiau meddalwedd ar gyfer arbrofion Hi-C a dadansoddi data a meddalwedd delweddu data hunanddatblygedig.

●Cefnogaeth Ôl-werthu:Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau'r prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis. Yn ystod y cyfnod hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.

●Anodiad Cynhwysfawr: rydym yn defnyddio cronfeydd data lluosog i anodi'r genynnau yn swyddogaethol ag amrywiadau a nodwyd a pherfformio'r dadansoddiad cyfoethogi cyfatebol, gan ddarparu mewnwelediad ar brosiectau ymchwil lluosog.

Manylebau Gwasanaeth

Llyfrgell

Strategaeth Dilyniant

Allbwn data a argymhellir

Datrysiad Signal Hi-C

Llyfrgell Hi-C

Illumina PE150

Dolen cromatin: 150x

TAD: 50x

Dolen Chromatin: 10Kb

TAD: 40Kb

Gofynion Gwasanaeth

Math o sampl	Swm gofynnol
Meinwe anifeiliaid	≥2g
Gwaed Cyfan	≥2mL
Ffyngau	≥1g
Planhigyn - meinwe ifanc	1g/aliquot, argymhellir 2-4 dyfyniad
Celloedd Diwylliedig	≥1x10⁷

Pâr o: TGuide Smart Magnetig Planhigion RNA Kit

Nesaf: DNBSEQ llyfrgelloedd wedi'u gwneud ymlaen llaw

Yn cynnwys y dadansoddiad canlynol:

● Data crai QC;

● Mapio a Hi-C llyfrgell QC: parau rhyngweithio dilys ac Esbonwyr Pydredd Rhyngweithio (IDEs);

● Proffilio Rhyngweithio Genom-gyfan: dadansoddiad cis/trans a map rhyngweithio Hi-C;

● Dadansoddiad o ddosbarthiad adran A/B;

● Adnabod TADs a dolenni cromatin;

● Dadansoddiad gwahaniaethol ar elfennau strwythur cromatin 3D ymhlith samplau ac anodi swyddogaethol cyfatebol o enynnau cysylltiedig.

Cis a dosbarthiad cyfrannedd traws

Map gwres o ryngweithiadau cromosomaidd rhwng samplau

Dosbarthiad genom-eang o adrannau A/B

Dosbarthiad genom-eang dolenni cromatin

Delweddu TADs

Archwiliwch y datblygiadau ymchwil a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu Hi-C BMKGene trwy gasgliad o gyhoeddiadau wedi'u curadu.

Meng, T. et al. (2021) 'Mae dadansoddiad aml-omeg integredig cymharol yn nodi CA2 fel targed newydd ar gyfer cordoma',Niwro-Oncoleg, 23(10), tt. 1709–1722. doi: 10.1093/NEUONC/NOAB156.

Xu, L. et al. (2021) 'Mae anhrefn 3D ac ad-drefnu genom yn rhoi mewnwelediad i bathogenesis NAFLD trwy ddilyniannu Hi-C, Nanopore, ac RNA integredig',Acta Pharmaceutica Sinica B, 11(10), tt. 3150–3164. doi: 10.1016/J.APSB.2021.03.022.