Dadansoddiad Cymdeithas Genom-eang
Llif gwaith
Manteision Gwasanaeth
●Arbenigedd helaeth a chofnodion cyhoeddi: gyda phrofiad cronedig yn GWAS, mae BMKGene wedi cwblhau cannoedd o brosiectau rhywogaethau mewn ymchwil GWAS poblogaeth, wedi cynorthwyo ymchwilwyr i gyhoeddi mwy na 100 o erthyglau, a chyrhaeddodd y ffactor effaith gronnus 500.
● Dadansoddiad biowybodeg cynhwysfawr: mae llif gwaith yn cynnwys dadansoddiad cysylltiad nodweddion PCE, gan gyflwyno set o enynnau ymgeisydd a'u hanodiad swyddogaethol cyfatebol.
●Tîm biowybodeg hynod fedrus a chylch dadansoddi byr: gyda phrofiad gwych mewn dadansoddi genomeg uwch, mae tîm BMKGene yn cyflwyno dadansoddiadau cynhwysfawr gydag amser gweithredu cyflym.
●Cefnogaeth Ôl-werthu:Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau'r prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis. Yn ystod y cyfnod hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.
Manylebau a gofynion gwasanaeth
| Math o ddilyniant | Graddfa boblogaeth a argymhellir | Strategaeth ddilyniannu | Gofynion niwcleotid |
| Dilyniannu Genom Cyfan | 200 o samplau | 10x | Crynodiad: ≥ 1 ng/ µL Cyfanswm ≥ 30ng Diraddio neu halogiad cyfyngedig neu ddim o gwbl |
| Darn Chwyddedig â Locws Penodol (SLAF) | Dyfnder tag: 10x Nifer y tagiau: < 400 Mb: Argymhellir WGS < 1Gb: tagiau 100K 1Gb > 2Gb: tagiau 300K Uchafswm o 500k o dagiau | Crynodiad ≥ 5 ng/µL Cyfanswm ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280=1.6-2.5 Gel agarose: dim neu ddiffyg diraddio neu halogiad cyfyngedig
|
Dewis Deunydd
Gwahanol fathau, isrywogaethau, tirrasau/banciau geneu/teuluoedd cymysg/adnoddau gwyllt
Gwahanol fathau, isrywogaethau, tirrasau
Teulu hanner sib/teulu llawn-sib/adnoddau gwyllt
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dyluniad arbrawf
Cyflwyno sampl
echdynnu RNA
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Yn cynnwys y dadansoddiad canlynol:
- Dadansoddiad cymdeithas genom-eang: model LM, LMM, EMMAX, FATLMM
- Anodi ymarferol genynnau ymgeisydd
Dadansoddiad o gymdeithas nodweddion SNP – plot Manhattan
Dadansoddiad cysylltiad nodweddion PCE – plot QQ
Archwiliwch y datblygiadau a hwyluswyd gan wasanaethau de GWAS BMKGene trwy gasgliad o gyhoeddiadau wedi'u curadu:
Lv, L. et al. (2023) 'Cipolwg ar sail genetig goddefgarwch amonia mewn clam razor Sinonovacula constricta trwy astudiaeth cysylltiad genom-eang',Dyframaethu, 569, t. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Mae dadansoddiadau aml-omeg o 398 o dderbyniadau miled cynffon y llwynog yn datgelu rhanbarthau genomig sy'n gysylltiedig â dofi, nodweddion metabolion, ac effeithiau gwrthlidiol',Planhigyn Moleciwlaidd, 15(8), tt. 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Mapio Cymdeithas Genom-Eang o Ffenoteipiau Prin Hulless mewn Amgylchedd Sychder',Ffiniau mewn Gwyddor Planhigion, 13, t. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'Mae GmST1, sy'n amgodio sulfotransferase, yn rhoi ymwrthedd i straenau firws mosaig ffa soia G2 a G3',Offer, Cell a'r Amgylchedd, 44(8), tt. 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.
