Dilyniannu mRNA ewcaryotig-NGS
Nodweddion
● Dal polymRNA cyn paratoi'r llyfrgell
● Paratoi llyfrgell mRNA cyfeiriadol dewisol i alluogi cael data dilyniannu llinyn-benodol
● Dadansoddiad biowybodol o fynegiant genynnau a strwythur trawsgrifiadau
Manteision
●Arbenigedd helaeth: Mae ein tîm wedi prosesu dros 600,000 o samplau yn BMKgene, sy'n rhychwantu mathau amrywiol o samplau megis diwylliannau celloedd, meinweoedd a hylifau'r corff. Rydym yn dod â chyfoeth o brofiad i bob prosiect ac wedi cwblhau dros 100,000 o brosiectau mRNA-Seq yn llwyddiannus mewn amrywiol feysydd ymchwil.
●Rheoli Ansawdd Trwyadl: Rydym yn gweithredu pwyntiau rheoli craidd ar draws pob cam, o baratoi sampl a llyfrgell i ddilyniannu a biowybodeg. Mae'r monitro manwl hwn yn sicrhau canlyniadau cyson o ansawdd uchel, gan eich sicrhau bod eich prosiect mewn dwylo dibynadwy.
●Anodiad Cynhwysfawr: Rydym yn defnyddio cronfeydd data lluosog i anodi'r Genynnau a Fynegwyd yn Wahanol (DEGs) yn swyddogaethol a chynnal dadansoddiadau cyfoethogi cyfatebol. Mae'r ymagwedd gynhwysfawr hon yn rhoi cipolwg ar y prosesau cellog a moleciwlaidd sy'n sail i'r ymateb trawsgrifio, gan sicrhau eich bod yn cael eich hysbysu'n llawn am ganlyniadau eich prosiect.
●Cefnogaeth Ôl-werthu: Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau'r prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis. Yn ystod y cyfnod hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.
Gofynion Sampl a Chyflenwi
| Llyfrgell | Strategaeth ddilyniannu | Argymhellir data | Rheoli Ansawdd |
| Poly A cyfoethogi | Illumina PE150 DNBSEQ-T7 | 6 -10 Gb | C30≥85% |
Gofynion Sampl:
Niwcleotidau:
| Conc.(ng/μl) | Swm (μg) | Purdeb | Uniondeb | |
| Llyfrgell Safonol | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Cyfyngedig neu ddim halogiad protein neu DNA a ddangosir ar gel. | Ar gyfer planhigion: RIN≥4.0; Ar gyfer anifeiliaid: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; drychiad gwaelodlin cyfyngedig neu ddim drychiad gwaelodlin |
| Llyfrgell Gyfeiriadol | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Cyfyngedig neu ddim halogiad protein neu DNA a ddangosir ar gel. | Ar gyfer planhigion: RIN≥4.0; Ar gyfer anifeiliaid: RIN≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; drychiad gwaelodlin cyfyngedig neu ddim drychiad gwaelodlin |
● Planhigion:
Gwraidd, Coesyn neu Petal: 450 mg
Deilen neu Had: 300 mg
Ffrwythau: 1.2 g
●Anifail:
Calon neu Berfedd: 300 mg
Viscera neu Ymennydd: 240 mg
Cyhyr: 450 mg
Esgyrn, Gwallt neu Groen: 1g
● Arthropodau:
pryfed: 6g
Cramenogion: 300 mg
● Gwaed cyfan: 1 tiwb
● Celloedd:106 celloedd
Cyflwyno Sampl a Argymhellir
Cynhwysydd: tiwb centrifuge 2 ml (Ni argymhellir ffoil tun)
Labelu enghreifftiol: Grŵp+ at ei gilydd ee A1, A2, A3; B1, B2, B3......
Cludo:
1. Iâ sych: Mae angen pacio samplau mewn bagiau a'u claddu mewn rhew sych.
2. Tiwbiau bwrdd RNAs: Gellir sychu samplau RNA mewn tiwb sefydlogi RNA (ee RNAstable®) a'u cludo yn nhymheredd yr ystafell.
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dyluniad arbrawf
Cyflwyno sampl
echdynnu RNA
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Biowybodeg
Ewcaryotig llif gwaith dadansoddi dilyniannu mRNA
Biowybodeg
ØRheoli ansawdd data crai
ØAliniad genom cyfeirio
ØDadansoddiad strwythur trawsgrifiad
ØMeintioli mynegiant
ØDadansoddiad mynegiant gwahaniaethol
ØAnodi swyddogaeth a chyfoethogi
Aliniad Genom Cyfeirnod
Dirlawnder Data
Cydberthynas sampl ac asesiad o atgynhyrchiadau biolegol
Genynnau a Fynegwyd yn Wahanol (DEGs)
Anodi Swyddogaethol o DEGs
Cyfoethogi Swyddogaethol DEGs
Archwiliwch y datblygiadau a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu mRNA NGS ewcaryotig BMKGene trwy gasgliad o gyhoeddiadau wedi'u curadu.
Huang, L. et al. (2023) 'Mae triclosan a triclocarban yn gwanhau cynhwysedd arogleuol pysgod aur trwy gyfyngu ar adnabyddiaeth arogleuon, amharu ar drawsgludiad signal arogleuol, ac aflonyddu ar brosesu gwybodaeth arogleuol', Water Research, 233, t. 119736. doi: 10.1016/J.WATRES.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus yn herwgipio dynol t11 i ailgyfeirio ffagosomau sy'n cynnwys ffwng i lwybr anddiraddiol', Cell Host & Microbe, 31(3), tt. 373-388.e10. doi: 10.1016/J.CHOM.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'Ffactorau Trawsgrifio TCP sy'n Ymwneud â Datblygiad Saethu Ma Bambŵ (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers in Plant Science, 13, t. 884443. doi: 10.3389/FPLS.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'Genom Chrysanthemum lavandulifolium a'r mecanwaith moleciwlaidd sy'n sail i fathau amrywiol o gapitwlwm', Horticulture Research, 9. doi: 10.1093/HR/UHAB022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'Nanoreactor rhaeadru ar gyfer gwella therapi sonodinamig ar ganser y colon a'r rhefr trwy ychwanegiad ROS synergaidd a rhwystriad awtophagi', Nano Today, 49, t. 101798. doi: 10.1016/J.NANTOD.2023.101798.
